🎸 Пока вы веселитесь на рок-концертах в пятничку вечером, ваш любимый отвязный беспечный музыкант... может отмечать получение докторской степени! Декстер Холланд, солист группы Offspring, вчера защитил диссертацию по молекулярной биологии - о механизмах ВИЧ инфекции. 🤓 Заниматься наукой он начал еще до успеха группы в 1994-м году, исследования пришлось прервать ради музыкальной карьеры. Сейчас Декстеру 51 год, и этот новоиспеченный доктор готовится к очередным гастролям.
Батрахоспермум одолел 183-страничный опус певца и готов рассказать суть работы.
Для проникновения ВИЧ в лимфоцит человека необходимо наличие на его поверхности рецептора CD4 и корецептора. Обычно прикрепление патогена к CD4 вызывает иммунный ответ организма и атаку. Вирус же блокирует и использует рецептор, чтобы попасть внутрь клетки незамеченным и захватить ее. 😈 С помощью in silico исследований (компьютерных вычислений) команда Декстера определила три новые виральные последовательности микроРНК, которые после абордажа лимфоцита подавляют экспрессию мРНК, необходимых для работы CD4 так, чтобы рецептор не мешал дальнейшему развитию и размножению вируса (а он может).
Короче... Это еще одна работа по биоинформатике, в которой с помощью популярных скриптов перелопачено пол существующей онлайн базы экспрессии генов по ВИЧ. Ну, а почему нет? Кирстен Стюарт ведь опубликовала научную статью по искусственному интеллекту. 💃🏻 Она описывает использование алгоритмов машинного обучения для преобразования кадров фильма в изображение, имитирующее живопись... Но это совсем другая история 😃
Новость: https://consequenceofsound.net/2017/05/the-offsprings-dexter-holland-has-received-a-ph-d-in-molecular-biology/
Статья Декстера Холланда: http://digitallibrary.usc.edu/cdm/compoundobject/collection/p15799coll40/id/364391/rec/1
Статья Кирстен Стюарт: http://www.theverge.com/tldr/2017/1/20/14334242/kristen-stewart-machine-learning-paper-ai
🎈Закончились праздники, наступило время возвращаться в офис. Не стоит скучать по сокращенным рабочим дням! Последнее исследование показало, что укороченная неделя только увеличивает стресс - ведь все боятся не успеть закончить задачи вовремя (https://goo.gl/byz9TQ).
Вот небольшой дайджест о том, что вы могли пропустить, пока отдыхали.
🐲 Нового шеститонного анкилозавра с оборонительной булавой на хвосте назвали Zuul crurivastator за сходство с демоном Зуулом из фильма "Охотники за привидениями" (1984). (https://goo.gl/cDEi5g)
🤕 Ученые давно ковыряются в усохших мозгах умерших великих ученых, чтобы понять, в чем секрет их гениальности. На этот раз они добрались и до Декарта, правда, пришлось использовать компьютерную 3д-модель, основанную на данных о форме черепа. К сожалению, мозг французского математика оказался в целом таким же, как у всех. Что ж, он и сам говорил, что "главное не большой ум, а умение его применять". (https://goo.gl/EcsuYC)
🐢 В Корее инженеры-биологи научили робота издеваться над черепахой. Электромеханический маньяк сел Тортилле на спину и светил красной лампочкой перед ней. Если черепаха ползла в направлении света, робот выдавал ей порцию еды. Закончив дрессировку, бесстыжий просто катался на несчастном животном по своим делам. (https://goo.gl/OIgaCu)
🎼 В Великобритании получили еще одно доказательство того, что аутисты воспринимают мир иначе. Их уникальный слух подтвердился следующим тестом. Испытуемым включали аудиодорожку со смесью разных звуков, длиной всего 100 миллисекунд каждый, из которых нужно было выделить крики определенных животных. Запись создавала впечатление, что человек окружен зверьми, шастающими от него на разном расстоянии, а вслушиваться мешали прочие бытовые и уличные шумы. Контрольная группа плохо справилась с заданием. А аутисты, как оказалось, даже в страшной какофонии слышат каждый звук отдельно, что говорит о том, что их мозг способен обработать гораздо больше получаемой информации, чем обычный человек. (https://goo.gl/mKVRH6)
📚 Дэниэль Финкель утверждает, что в школах неправильно преподают математику. Нас не учат интуитивному восприятию чисел, особенно когда дело касается умножения и сложения. Ученый сравнивает простые числа с ДНК и говорит, что правильное отношение к ним - залог развития математических способностей. Нужно понимать, что любое большое число сложено из кусочков, кодонов - простых чисел. Чтобы перевернуть ваш мир с ног на голову, Дэниэль создал особую графическую визуализацию известных со школы таблиц. Обязательно посмотрите их здесь: https://goo.gl/hf31mC.
Поделитесь мнением, задайте вопросы, расскажите что-нибудь интересное в нашем телеграм-чатике: @supscience 😼
Муравьи определяют личинок-королев по запаху. Восковой слой оболочки личинки благородного сословия отличается по химическому составу. Так ученые впервые обнаружили феромоны, с помощью которых муравьи-рабочие узнают своих будущих повелительниц.
Кроме этого выяснилось, что если личинка начинает "пахнуть" принцессой невовремя, например, в середине зимы, ее предупредительно покусывают, чтобы остановить беспредел и зря не тратить ресурсы. То же происходит, если королев намечается больше, чем может прокормить муравейник.
А еще, в одном из экспериментов ученые заставили рабочих поверить, что королева - самец. Никакого уважения!
Статья: https://news.ncsu.edu/2017/05/princess-pheromone-2017/
Видео воспитательного погрыза личинки: https://vimeo.com/212090021
Безжалостные социологи добрались и до ящериц. До этого опыты ставили в основном на млекопитающих и птицах, чтобы понять, как их окружение в юности и отрочестве влияет на поведение в зрелом возрасте. Чаще всего от продолжительного одиночества животные становились замкнутыми, боязливыми, тревожными. Для древесных сцинков же оказалось, что больше стресса они испытывают в паре - причем как находясь в пассивной роли, так и в активной. Подавляемый товарищ плохо растет, часто теряет хвост. А доминирующая рептилия становится агрессивной рисковой авантюристкой. Да, только такая дерзкая ящерица могла стать офицером полиции в Аризоне, где она сейчас вынюхивает запрещенные препараты, но это уже совсем другая история...
https://phys.org/news/2017-05-roommates-theyre-youre-lizard.html
💃🏻 Не знаешь, как отбиться от назойливого ухажера? Упади на землю и притворись мертвой! Именно так поступают стрекозы Aeshna juncea, голубые коромысла. Если самку преследует неприятный самец, она говорит: «ой, все!» – и перестает работать крыльями, падает наземь и лежит неподвижно, пока самец не улетит, а когда небо очистится от поклонников, поднимается и летит по своим девичьим делам.
Самка голубого коромысла испытывает харассмент в период откладки яиц, потому что в отличие от многих других стрекоз при ней в этот момент нет партнера, который ее охранял бы от посягательств других самцов. А ведь любая новая копуляция запросто может повредить ей репродуктивные органы. Так что стрекозы предпочитают избегать самцов, прячась в растительности у прудов или притворяясь мертвенькой.
Подобное поведение известно у двух видов ктырей, у религиозных богомолов и у пауков пизаур удивительных (в последних случаях к нему прибегают самцы). Обычно мертвыми притворяются, чтобы ввести в заблуждение хищника, и, возможно, коромысла поначалу для этого и применяли свои драматические таланты, а позже стали использовать мастерство и в личной жизни. Ишь, артистки!
https://www.newscientist.com/article/2129185-female-dragonflies-fake-sudden-death-to-avoid-male-advances/
Американские ученые, получившие в 2015 году Шнобелевскую премию за открытие мочеиспускательной константы, на этот раз ударились в дефекацию. Большинство млекопитающих, независимо от размеров и массы тела, опорожняют кишечник примерно за одно и то же время – 12 секунд, утверждают они. Также они установили кучу любопытных пикантных деталей. Результаты изысканий опубликованы в научном журнале «Мягкая материя». 💩
Рассказываем подробно: http://batrachospermum.ru/2017/04/defecation-hydrodynamics/
Свежее открытие, описанное в журнале Nature! Несколько лет назад ученые из Испании и Италии опустили телеуправляемый аппарат к вершине вулкана Тагоро, извергавшегося в 2011–2012 годах неподалеку от испанского острова Иерро в Канарском архипелаге. И на глубине около 130 метров их глазам предстала удивительная картина: темные лавовые породы были сплошь усеяны таинственными седыми волосами! Неужели на свежих магматических выплесках какой-то подводный цирюльник стрижет престарелых русалок? 😳
Продолжение: 👉 http://batrachospermum.ru/2017/04/thiolava-veneris/
🌳 Представьте, что вечером аллея, по которой вы возвращаетесь домой, освещается не фонарями, а... деревьями! Похоже на кадр из фэнтезийного фильма. Однако совсем недавно идея была невероятно близка к реальности - на прошлой неделе закрылся проект Glowing Plant на Кикстартере. Целью проекта было сокращение потребления электрической энергии в городах. На протяжении четырех лет Энтони Эванс со своей командой с помощью агробактерий как векторов пытался встроить 6 новых генов в резуховидку (Arabidopsis).
🌠 Свечение бактерий и светлячков обеспечивает система из нескольких белков, закодированных в связанных между собой генах. Два из них образуют сигнальную молекулу – автоиндуктор. Он присоединяется к промотору – участку в начале гена, который запускает процесс синтеза матричной РНК, что приводит к синтезу и самих вспомогательных белков, и фермента люциферазы. Молекула люциферина под действием люциферазы меняет свою конфигурацию, испуская фотон. То же самое должно было происходить в растениях Энтони Эванса. Но ему удалось добиться только очень слабого свечения.
На самом деле, на Кикстартере достаточно много проектов, связанных с синтетической биологией. К сожалению, многие из них сдуваются, что соответсвует тенденциям в мире биотехнологических стартапов. Все-таки к теме колдовства над генами по-прежнему много недоверия, поэтому и найти инвестора сложнее. Но кому-то везет. Так, Bolt Threads уже продает первые галстуки, сплетенные из паутины (она по прочности сравнима с нейлоном). Правда, плетут их не пауки, а специальные бактерии из своих испражнений, хотя вряд ли кто-то из покупателей вдавался в такие подробности 💩 Другая компания, Ginkgo Bioworks, занимается дрожжами, пахнущими розами, для создания компонентов дорогих духов. Они также самодовольно заявляли, что их дрожжи однажды смогут повторить запах цветов эпохи ледникового периода, только дайте, мол, замерзший образец.
Интересно, что нам будут предлагать на краудфандинговых платформах лет через пять. 👽
Источник: https://www.theatlantic.com/science/archive/2017/04/whatever-happened-to-the-glowing-plant-kickstarter/523551/
Пятница - самый подходящий день, чтобы рассказать вам о том, как раки выразительно пьянеют: сначала встают на полностью выпрямленных ногах, агрессивно нависая над дерзким ландшафтом, затем отбрыкиваются от субстрата с помощью хвоста и, совершив неуклюжее сальто, заваливаются на спину, не в состоянии больше подняться.
Давно известно, что социальный статус раков влияет на их поведение. Специалисты из Мэрилендского университета в Колледж-Парке (США) определили, что и алкогольное опьянение наступает быстрее или медленнее в зависимости от того, есть ли у рачка друзяшки. Описание экспериментов и причины явления читаем тут:
👉 http://batrachospermum.ru/2017/04/drunken-crayfish/
Знаем, вы часто не можете уснуть, размышляя о том, как усложняются организмы в процессе эволюции, как укрупняются их геномы, появляются новые функции. Согласно господствующей теории, это происходит из-за дупликаций генома. Эти же дупликации за миллионы лет привели к тому, что большая часть ДНК стала «мусорной». Но интересно, могут ли гены возникать из «мусорной» ДНК? Когда-то это считалось невозможным. Однако данные, полученные в последние годы, убеждают ученых, что гены, возникшие из некодирующей ДНК, так сказать de novo, действительно существуют. И их немало, они составляют значительную часть генома, хотя об их функциях пока что практически ничего не известно.
Рассказываем обстоятельно:
👉 http://batrachospermum.ru/2017/04/de-novo-genes/
Моллюск торчит головой вниз, а наружу выставляет сифоны для дыхания на заднем конце. Кормят его симбиотические серобактерии, которые получают энергию за счет окисления сероводорода.
Читать полностью…Ученым впервые удалось наблюдать работу каждого нейрона во всем теле животного! 😃 Этим животным стала гидра обыкновенная (Hydra vulgaris), обладательница одной из самых простых нервных систем – это несколько тысяч нервных клеток, распределенных по всему ее малюсенькому тельцу, без всякого мозга.
Гидру генетически модифицировали так, чтобы нейроны светились в присутствии ионов кальция, чья концентрация возрастает при возбуждении. Так стало возможным увидеть, какой нервный контур активен при пищеварении, какой отвечает за съеживание во время опасности, какой реагирует на свет (глаз у гидры нет, но свет влияет на ее поведение, например, на свету она активнее охотится). Важно, что любой нейрон у нее входит лишь в один контур – на каждый рефлекс у нее свой отдельный контур, не то что у вас, сложнячков-переплетенок.
https://www.youtube.com/watch?v=VA72wmRaF4A
http://www.cell.com/current-biology/abstract/S0960-9822(17)30220-8
Биосфера может простираться намного глубже, чем мы думаем: до 10 км ниже океанического дна! 😦 В образцах серпентинита из подводного грязевого вулкана Южный Чаморро, что неподалеку от Марианской впадины, обнаружены углеводороды и аминокислоты, точнее, «алифатические и ароматические соединения и функциональные группы, такие как амиды». По мнению авторов открытия, это говорит о том, что до того, как плавучие серпентиниты поднялись с глубины и изверглись, в них жили отважные и скрытные микробы!
Хотя не исключено, что обнаруженная органика попала туда из коры или появилась в результате абиотических процессов, в теории на таких глубинах вполне могут быть условия для существования тайных экосистем. Во-первых, в зоне субдукции, то есть погружения океанической коры, температура может не превышать 122°C (предел для микробной жизни). Во-вторых, нужные для жизни молекулы и энергия могут поставляться за счет химических реакций – той же серпентинизации, которая обеспечивает всем необходимым ребят, живущих возле гидротермальных источников.
http://news.nationalgeographic.com/2017/04/deepest-life-earth-mariana-trench-astrobiology-science/
http://www.pnas.org/content/early/2017/04/04/1612147114.abstract
Высшие головоногие моллюски в очередной раз подтверждают свою «инопланетность» в сравнении с остальными жителями Земли. Если большинство животных эволюционируют, полагаясь на мутации ДНК, то осьминоги, кальмары и каракатицы предпочитают изменениям генома редактирование РНК! О преданном копировании информации с ДНК на РНК – генетической основе дарвиновской эволюции – они и слышать не желают: согласно новому исследованию, редактированию у них подвергаются больше половины молекул РНК, скопированных с генов. И возможно, именно поэтому они такие умные. 🐙
Подробности:
👉 http://batrachospermum.ru/2017/04/strange-genes-cephalopods/
Улитка-спайдермен - супергерой дня! Thylacodes vandyensis, новый вид брюхоногих моллюсков из семейства червячковых (Vermetidae), прозвали «улиткой-спайдерменом»: на ноге у него есть «руки» (дополнительная пара щупалец), из них он стреляет слизью, превращающейся в воде в сеть, где застревают микробы и планктон. Добычу он затем затягивает в рот и сцеживает зазубринами на языке.
Живет моллюск в раковине неправильной трубчатой формы, прикрепившись к корпусу списанного корабля «Генерал Хойт С. Ванденберг», который был затоплен в 2008 году у берегов Флориды в качестве искусственного рифа. Это единственное место, где обнаружены T. vandyensis, и, как можно догадаться, назван вид в честь корабля. Ученые полагают, что вид инвазивный, принесенный из Индо-Пацифики, где он пока не обнаружен, зато там живут похожие червячковые улитки.
Научная статья: https://peerj.com/articles/3158/
https://www.fieldmuseum.org/science/blog/spiderman-worm-snails-discovered-florida-shipwreck
Лори радуется переезду в реабилитационный центр Пекина. Фото: China Stringer Network/Reuters
А у нас опрос. Сколько постов в день вы хотели бы видеть в нашем канале?
Рыбы-прилипалы и рыбы-носороги соревнуются с Василием Кандинским в абстракционизме на Мальдивах. Фото: Andrey Nekrasov
Читать полностью…Новые виды бобовых Daviesia schwarzenegger и D. devito названы в честь А. Шварценеггера и Дэнни Де Вито, исполнивших главные роли в фильме «Близнецы» 😆
Видео с героями: https://youtu.be/Hjfxo--6_6s
Хитрая женщина и две альпаки что-то замышляют в городской библиотеке 🤔 Фото с Реддит: u/orosolido41
Читать полностью…Да что ж такое! Люди оказывают влияние на природу даже из могил!😵
Человеческие тела – это целый мешок химических элементов: железо, цинк, сера, кальций, фосфор, даже ртуть из пломб. Все это попадает в почву при разложении. Большая часть могла бы затем использоваться растениями в полях, лесах, саваннах, да вот незадача: из-за традиции захоранивать покойников в определенных местах сильно нарушается естественное распределение элементов в почве! Чем больше людей на Земле, тем больше кладбища, тем больше неравномерность, и все это нам аукнется, посетовал Ладислав Смейда из Чешского агротехнического университета в Праге на конференции Европейского союза наук о Земле в Вене.
Об усугубляющейся неравномерности его научная группа узнала, проанализировав рентгеновской флуоресцентной спектроскопией почвы в могилах, местах рассеивания пепла от кремации и под тушами животных, оставленных на открытом воздухе для имитации древнего обряда экскарнации. Во всех трех случаях почва содержала намного более высокие концентрации химических веществ, чем на других участках.
Вот если бы люди, как нормальные животные, разлагались там, где умирают, их составляющие пошли бы на пользу природе, а так они сконцентрированы на кладбищах, и толку от них нет, печалится Смейда. Может, стоит подумать о каком-то новом, "эко-френдли" способе прощаться с близкими?
https://phys.org/news/2017-04-humans-earth-chemistry-grave.html
О древнейшем эукариотическом многоклеточном организме вновь сообщают шведские палеобиологи, и на этот раз речь о грибе – по крайней мере так интерпретируются нитевидные структуры возрастом 2,4 млрд лет, найденные в окаменевших пузырях и трещинах в базальтах древнего океанского дна на западе ЮАР.
«Когда я увеличил увеличение микроскопа, то поразился, – говорит один из авторов исследования. – Пузырьки были заполнены сотнями прелестно сохранившихся филаментов, которые буквально кричали: жиииииииизнь!»
Что мы имеем:
- древнейшие многоклеточные эукариоты кроновой группы (то есть родственники существующих сегодня эукариот) – красные водоросли возрастом 1,2 млрд лет;
- еще одни претенденты на это звание, тоже красные водоросли, о которых мы недавно писали (batrachospermum.ru/2017/03/oldest-red-algae), – открытие той же научной группы, только на этот раз шведы почему-то о нем не упоминают, возраст находки 1,6 млрд лет;
- есть кандидат в древнейшие грибы возрастом 1,4 млрд лет;
- древнейшие эукариоты стволовой группы (то есть такие, которые существовали до появления современных царств), до 1,9 млрд лет;
- спорные находки якобы эукариотической сущности, 2,1 млрд лет;
- и вот новый гриб, а может, и не гриб вовсе, а что-то грибообразное, но явно эукариотическое, утверждают авторы.
Что еще важно, 2,4 млрд лет назад в атмосфере только начал накапливаться кислород в обильных количествах (т. н. кислородная катастрофа, или кислородная революция), и эти «грибочки», судя по всему, дышали еще не им и, скорее всего, существовали в симбиозе с хемосинтетическими микробами, говорят ученые.
Научная статья: https://www.nature.com/articles/s41559-017-0141
Пятница. Немецкая утка вздохнула с облегчением и зарылась от будничных проблем в снежок. Хороших выходных!
Фото: Karl-Josef Hildenbrand
Вегетарианец болотный валлаби был застукан за пожиранием крыла мертвого тонкоклювого буревестника 😳 Дай этим сумчатым волю, они и тебя, наверно, загрызут, дорогой читатель...
Фото: James Fitzsimons
В Калифорнийском университете в Риверсайде (США) только что с помощью технологии CRISPR/Cas9 вывели красноглазых мутантов наездников Nasonia vitripennis. Для этого они достали яичко паразитоида из яйца серой мясной мухи Sarcophaga bullata, криспрнули и положили обратно. Данная технология редактирования генов впервые произведена на таком крошечном объекте, чванятся авторы работы. Красные глаза теперь будут передаваться в этой линии наездников из поколения в поколение. 😍 Зачем это было нужно? Да просто так. Чтобы лучше понимать биологию насекомых. Может, пригодится для контроля популяций. А может, и нет. Да прикольно же, ну. Ждем, когда человеку можно будет сделать глаза любого цвета. Или что-нибудь более полезное 😂
https://ucrtoday.ucr.edu/46222 | http://biorxiv.org/content/early/2016/12/23/096578
О существовании мифических гигантских (1-1.5 метра) корабельных червей Kuphus polythalamia ученые до сих пор знали лишь по вымываемым на пляжи длиннющим трубчатым домикам, описанным еще в 1758 году Карлом Линнеем!😃
Некоторые биологи всю свою карьеру искали живого куфуса. Никто не знал, где они живут, пока в 2010 году в YouTube не всплыл репортаж с филиппинского ТВ, где странного червя из подозрительно знакомой трубки местные жители поедали как бы в лечебных целях. Ученые сразу снарядили экспедицию – безуспешно. В 2011 году еще одну – и вот тогда-то в бывшем водоеме для лесосплава на острове Минданао нашлась целая колония куфусов, торчащих из вонючей морской грязи!
Что интересно, K. polythalamia – не червь, а самый длинный двустворчатый моллюск в современном мире.
Подробности у нас в журнале: http://batrachospermum.ru/2017/04/kuphus-polythalamia/
Благодаря Юрию Гагарину дрозофила может ощущать гравитацию! Ген yuri gagarin кодирует белок, играющий роль в гравитаксисе, а кроме того, он задействован в сперматогенезе. С Днем космонавтики!
Читать полностью…Известные предельные глубины, где находили представителей разных царств и доменов жизни. Включая дьявольских червей H. mephisto, открытых в 2011 году на золотодобывающих шахтах в ЮАР.
Читать полностью…Новый червячковый моллюск Thylacodes vandyensis живет на затопленном корабле возле Флориды, ловит микробов и планктон слизистой сетью, как Человек-Паук! Раковина его размером с палец. Средний палец.
Читать полностью…Suvorovella – один из древнейших скелетных макроорганизмов. Диаметр этих НЛО до 10 см, их экзоскелеты слагают карбонатные породы Якутии конца эдиакария, 550–543 млн лет. 👽 Рисунок: Алина Коноваленко
Читать полностью…