6799
Всякая интересная всячина из мира биологии. Автор @lizaminina
Мы склонны считать, что у сложного организма должен быть и не менее сложный геном, в частности, по количеству генов. Конечно, человек, как казалось, должен быть в первых рядах! Однако в результате легендарного проекта "Геном человека" было показано, что, к удивлению всех, человеческий геном оказался очень небольшим, и в его состав входит всего лишь от 20 до 30 (или 25) тысяч генов. Более того, выяснилось, что ряд организмов с гораздо меньшей "развитостью" имеет то же, если не большее, число генов, чем у нас с вами. Так, в составе одного только генома кукурузы идентифицировали 33 тысяч генов!
Ну, хорошо, небольшой геном у нас с вами, мы смирились и приняли ситуацию. Но в конце прошлого года вышла работа (пока еще она имеет статус препринта), которая, наряду с некоторыми другими, показывает: в геноме человека содержатся тысячи ранее не известных генов! Более того, они активны, и с них считываются так называемые минибелки, которые объединяют в группу "темный протеом". Ключевую роль в работе составило изучение неканонических открытых рамок считывания (nORF от англ. Open Reading Frame), с которой и считывается пресловутый темный протеом, с помощью самых разных методов, как биоинформатических, так и методов молекулярной и клеточной биологии. В 2022 году в геноме человека обнаружили 7264 новых nORF. Теперь же, по оценкам авторов новой статьи, всего в генов геноме человека не более чем 100000, или, с меньшей вероятностью, 50000 тысяч генов.
Стоит, однако, отметить, что авторы обсуждаемой работы вовсе не являются пионерами в описании новых человеческих генов и минибелков. Так, три года назад на клеточных культурах были описаны 550 новых минибелков. Однако в новом исследовании с привлечением самых разных методов удалось детальнее охарактеризовать новые неканонические рамки считывания и их белковые продукты. В частности, в ходе разгребания авгиевых конюшен темного протеома было показано, что не менее 25% от 7264 новых ORF транскрибируется. То ли еще будет!
Это страшилище — недавно открытое гигантское ракообразное из отряда изопод, получившее название в честь Дарта Вейдера — Bathynomus vaderi. Авторы открытия решили, что голова этого жуткого животного (массой в килограмм, между прочим) напоминает шлем персонажа "Звездных войн". Примечательно, что этого необычного ракообразного ученые купили на рынке у местных рыбаков.
Читать полностью…
История, леденящая кровь. Выяснилось, что американские суслики не брезгуют мелкими млекопитающими вроде полевок и особенно их детенышами! Так что традиционный рацион сусликов, считавшихся травоядными и лишь изредка поедающих насекомых, птенцов и яйца, неожиданно пополнился.
Читать полностью…
Одна из моих любимых рубрик здесь — как можно было до такого додуматься? Действительно, во многих случаях ученые — люди творческие, и бурная фантазия им совсем не чужда. Недавно коллега Владимир Шитов @science_boy, который, между прочем, ведет канал "человек наук", поделился совершенно нетривиальным методом по изучению глубокого внутреннего мира мыши. Как 99,99% исследователей подошли бы к проблеме? Скорее всего, умертвили бы мышь, препарировали бы ее, отдельные органы исследовали с помощью гистологии или микроскопии. Но как подошел бы проблеме д'Артаньян или герой Адриано Челентано в фильме "Укрощение строптивого": они бы просто прижизненно просверлили дырку в мыши (конечно, под анастезией) и приставили к дырке микроскоп. Вуаля — и можно спокойно наблюдать за внутренними процессами внутри живой (пока еще) мыши. Просто, дико, возмутительно, но эффектно, согласитесь. Но, как было показано, с помощью этого метода можно и важные проблемы решать — например, следить за ростом метастазов. Интересно, что опубликовано это все безобразие не где-нибудь, а в Nature! Вот так вот, оказывается, бывает: шалость от науки оказывается не шалостью, а перспективным подходом.
Читать полностью…
Ничего необычного, просто эффектная обложка Science.
Читать полностью…
Это араукария — вечнозеленое хвойное растение, высота которого может достигать аж 90 м. Ареал его обитания включает Австралию, Америку и несколько островов. Одни только шишки этого здоровенного хвойника весят до 20 кг! Страшно даже представить, сколько бы мишуры ушло, чтобы нарядить араукарию к новому году.
Читать полностью…
Есть у меня одна маленькая слабость – я обожаю мерч. Все вот эти блокноты, ручки, футболки, стикеры для ноутбуков, ну, вы поняли. Но достать всякие ништяки по биологической тематике можно не только на конференциях и воркшопах, но и у PCR.SHOP. В PCR.SHOP можно приобрести самые разные товары и сувениры, посвященные различным биологическим сюжетам: от мягкого и теплого пледа, в который вплетена двойная спираль, и ночника с биологическими рисунками, создающего невероятно уютную атмосферу в комнате, до ювелирных украшений и предметов гардероба. Большая часть моего окружения – биологи, поэтому выбор подарка в этих случаях предопределен. Ну и, будем честны, и себя любимую тоже можно порадовать! Как постоянный клиент призываю обратить внимание на этот магазин, если вы выбираете подарки коллегам-биологам на разные праздники!
Читать полностью…
Приближается пора новогодних обещаний. Какие цели вы поставите себе в новом году?
Мои друзья из проекта «Машинное обучение в биологии и биомедицине» от OpenBio решили добавить немного волшебства ✨ и помочь исполнить желания, связанные с построением карьеры в сфере биоинформатики, обработки данных и машинного обучения.
🎁 На канале проекта до 31 декабря проводится розыгрыш трех грантов на обучение на курсе «Машинное обучение в биологии и биомедицине»! Будет три победителя, которые получат скидку 50%, 70% и 90% соответственно.
Переходите по ссылке, чтобы узнать детали и принять участие в розыгрыше!
💪 А для всех, кто не полагается на удачу, а верит только в свои силы, OpenBio дарит скидку 20% на курс по промокоду NEWYEAR.
Промокод активен до 31 декабря 23:59 и исчезнет вместе с боем курантов.🥂
Желаю всем удачи!
Недавно я писала об одном велеречивом одиноком дельфине, который постоянно оживленно беседует сам с собой. Вообще, похоже, звуковое общение китообразных — штука очень непростая и изучена далеко не до конца. Например, авторы недавнего исследования горбатых китов (Megaptera novaeangliae) показали, что их детеныши издают особые сигналы, направленные к матери, когда чувствуют голод. Сигнал голода, который издает голодный китенок, — это низкочастотная смесь «лая, фырканья, ворчания и отрыжки», как выразились авторы исследования. Вот такую вот странную палитру звуков издает голодный кит-малыш, обращаясь к своей маме.
Читать полностью…
Новое исследование, опубликованное в Nature, показало, что диатомовые водоросли умеют определять глубину своего погружения благодаря фитохромовым фоторецепторам, которые реагируют на весь видимый свет. Получая сигналы от фитохромов, диатомеи не только "оценивают" глубину погружения саму по себе, но и подлаживают фотосинтез под реальный уровень освещенности. Очень практично и удобно.
Читать полностью…
Говоря о породах животных с особыми фенотипами, мы обычно имеет в виду результаты длительной селекции, проводимой людьми. Но иногда животные с удивительными фенотипами получаются без всякого вмешательства со стороны человека. Один из самых ярких примеров — мэнские кошки, отличающиеся очень короткими хвостами (в отличие от бесхвостых кошек породы кимрик, о которой я ранее писала, хвост у них все-таки есть). Эти кошки жили изолированно на острове Мэн и, вероятно, из-за эффекта основателя в популяции закрепилась случайная мутация, из-за которой появился такой вот необычный признак — короткий хвост. Надо отметить, что короткохвостость в гомозиготе летальна, жизнеспособны только гетерозиготы, так что скрещивание кошек этой породы — торжество случайности.
Читать полностью…
Соседство бактерий и фагов не всегда заканчивается кровопролитием. Недавно было показано, что некоторые фаговые сообщества совершенно спокойно сосуществуют с клетками кишечной палочки (Escherichia coli), которые произошли от одного клона. Авторы работы тестировали разные комплекты фагов против неэвоционирующего штамма E. coli. Оказалось, что в колониях бактерий обосновывались два или более фага, которые мирно существовали друг с другом, несмотря на то что они жили в одной бактериальной колонии и вроде как должны были конкурировать друг с другом. Более того, что колония бактерий предоставляла фагам что-то вроде общежития. Так, некоторые бактерии создавали что-то вроде "ниш" для существования фагов. Так что одна бактериальная колония может дать начало целому сообществу бактерифагов.
Читать полностью…
Вы когда-нибудь разговаривали сами с собой вслух? Наверняка да. А вот недавно обнаруженный в Балтийском море дельфин, похоже, непрерывно ведет с собой своеобразную беседу. Вообще дельфины живут стаями, и оттого сам факт обнаружения одинокого дельфина уже нетривиален. Первоначально исследователи полагали, что этот дельфин, которого назвали Делле, или молчит, или испускает редкие сигналы, предназначенные для несуществующих собеседников. Но дельфин-одиночка в действительности ведет оживленную беседу сам с собой! В этих "разговорах" Делле использовал почти все сигналы, присущие дельфинам в общении, включая свист, щелчки и даже сигналы агрессивного поведения, словно он общается минимум с двумя собеседниками. Вероятно, непрерывная "болтовня" помогает Делле переживать одиночество (к слову, причины его одиночества до конца не выяснены).
Читать полностью…
Как пелось в одной популярной песне, "даже если вам немного за тридцать, есть надежда выйти замуж за принца". Этого девиза придерживается самка альбатроса по имени Уиздом, которой ни много ни мало 73 года, а то и больше! Так что Уиздом — это старейшая из ныне живущих птиц, за что она и получила свое имя (от англ. wisdom — мудрость). Но самое интересное и удивительное не в этом. Несмотря на почтенный возраст, Уиздом продолжает размножаться! У альбатросов самки и самцы образуют пары на несколько сезонов размножения, а Уиздом потеряла своего партнера в 2021 году. Крайнее, но не последнее яйцо она отложила в 2020 году. А сейчас она состоит в новых отношениях с альбатросом, который младше ее на страшно сказать сколько лет, и даже ухитрилась недавно снести очередное и, по всей видимости, здоровое яйцо. Всего же за свою долгую жизнь Уиздом произвела на свет около 50—60 яиц и вырастила 30 птенцов. На фото — то самое недавно отложенное яйцо, которое рассматривают Уиздом и ее новый партнер.
Читать полностью…
Нет, это не изгнание бесов и не способ казни. Это средневековое лечение эндометриоза. Считалось, что, если подвесить больную женщину вверх ногами и начать ее энергично трясти, то взбесившаяся матка вернется в положенное место.
Читать полностью…
Учёные из США проанализировали генетические коды более 4 000 собак и опросили 46 000 владельцев. Они выяснили, что гены действительно определяют поведение животного. Но вместе с тем, важны и окружающая среда, социализация и воспитание.¹
Если у вас есть собака или желание обзавестись питомцем, рекомендую посетить бесплатный вебинар Секреты успешной дрессировки от Московской академии сельского хозяйства.
Маленькая или большая собака, живет она в квартире или во дворе частного дома – с ней нужно заниматься и учиться правильному взаимодействию.
На вебинаре вы узнаете:
✔️ Как скорректировать поведение животного
✔️ Как избавиться от проблемного поведения собаки
✔️ Как добиться послушания
✔️ Почему запреты и наказания не работают
Проведет вебинар кинолог с 20-летним стажем Анастасия Меньшикова.
🕒 Узнайте подробнее о времени проведения и зарегистрируйтесь на вебинар по ссылке 👈🏻
————————————————
1. Dutrow EV, Serpell JA, Ostrander EA. Domestic dog lineages reveal genetic drivers of behavioral diversification. Cell. 2022;185(25):4737-4755.e18.
Реклама. АНО ДПО «МАСХ». ИНН: 7722392399
Машинное обучение уверенно шагает по планете. С его помощью авторы новой статьи, вышедшей в Nature на днях, разработали белки, связывающие основные компоненты змеиных ядов (да-да, проблема змеиных ядов актуальна и теперь, а вот с антидотами все еще проблемы) — α-нейротоксины с длинными и короткими цепями и цитотоксины из семейства 3FTx. Будем надеяться, что синтетические белки-антидоты покажут свою эффективность в реальных условиях.
Читать полностью…
Коллеги, делюсь с вами каналом «Научные конференции», который посвящен научным конференциям, круглым столам, открытым лекциям и другим мероприятиям для представителей естественных и технических наук.
Присоединяйтесь: @confsci
Подвезли необычную новость. В Аптекарском огороде МГУ расцвела удивительная кувшинка, которая обошла все детские энциклопедии, — виктория амазонская с листьями в 2 м в диаметре, которые выдерживают даже вес ребенка. Мелочь, а все равно приятно.
Читать полностью…
Хвастаюсь. Племянница подарила мне вот такую открытку на новый год.
Читать полностью…
Ничего необычного, просто чашки Петри с разновидностями грибков Penicillium и Aspergillus.
Читать полностью…
С удивлением узнала, что Александр Флеминг (да-да, который пенициллин открыл) был не только прекрасным ученым, но и деятельным масоном. Он состоял во многих масонских ложах в разных должностях и даже был избран первым великим диаконом Объединенной великой ложи Англии. Так что Флеминг, помимо ученого, удостоенного многих премий и регалий, был еще и вольным каменщиком.
Читать полностью…
Это очаровательное создание — водная мышь, которая совсем недавно была открыта в Перу. Это животное ведет полуводный образ жизни и даже имеет перепонки между пальцами.
Читать полностью…
Великий баскетболист, олимпийский чемпион Александр Белов скончался в возрасте 27 лет от крайне редкого заболевания — ангиосаркомы сердца. Эта очень редкая опухоль развивается из клеток эндотелия и перителия сосудов. Ангиосаркома отличается повышенной злокачественностью и метастазированием. Само же сердце легендарного Александра Белова, измененное болезнью, хранится в СЗГМУ им. Мечникова и выставляется как экспонат.
Читать полностью…
Когда мы заболеваем, то организм зачастую сам поднимает температуру тела, чтобы, помимо прочего, мобилизовать иммунитет. Как недавно было показано, холоднокровные позвоночные, например, рыбы (исследование было проведено на тилапии), при инфекции предпочитают перемещаться в теплую воду. Зачем? Причина — в температуре тела. Холоднокровные позвоночные с помощью такой поведенческой реакции стремятся поднять температуру тела и тем самым предотвратить гибель T-клеток и попутно усилить их эффекторные функции. Похоже, подъем температуры тела — популярный механизм для мобилизации иммунитета при недомогании.
Читать полностью…
📌 Друзья, напоминаем вам, что в следующий четверг, 19 декабря, в 18:00 состоится новогодний лекторий Нейрокампуса! В рамках лектория выступит Михаил Владимирович Синкин, д.м.н. и и.о. зав. кафедры медицинских нейротехнологий РНИМУ с лекцией о картировании коры мозга человека.
🎄 А еще после лекции состоится анонс магистратуры Нейрокампуса 2025, где вы сможете задать все интересующие вас вопросы о поступлении и учебе. И, конечно, новогоднее настроение и мандарины прилагаются! 😉
📆 Когда: 19 декабря, 18:00
📍 Где: Федеральный центр мозга и нейротехнологий, улица Островитянова, 1, стр. 10
❗️ Для участия в мероприятии необходима регистрация
Для прохода в здание не забудьте взять паспорт!
🎬 Как обычно, запись лекции будет доступна и опубликована на нашей странице в VK, также на канале Нейрокампуса в Rutube. Ссылка на трансляцию будет выложена позднее.
🎓Магистратура Нейрокампус
🧠 Сайт Нейрокампуса
🧠 Страница Нейрокампуса в VK
Все мы со школы помним таблицу стандартного генетического кода, где каждому триплету нуклеотидов была сопоставлена аминокислота (или не сопоставлена, если идет речь о стоп-кодонах). Действительно, этот генетический код для перевода нуклеотидной последовательности в последовательность аминокислот использует абсолютное большинство живых организмов (есть, правда, неожиданные исключения, я писала о них в статье для Биомолекулы @biomolecula). А на днях в PNAS вышло очень интересное исследование, авторы которого задумались о том, как эволюционировал генетический код, какие аминокислоты стали протеиногенными и каким кодом вообще пользовался последний общий предок — LUCA. Было показано, что маленькие аминокислоты первыми вошли в генетический код. Связывающие металл аминокислоты цистеин и гистидин, а также серосодержащие аминокислоты цистеин и метионин вошли в состав генетического кода значительно раньше, чем показали предыдущие исследования. Вероятно, метал-зависимый катализ и метаболизм серы были особенно важны на заре жизни. А вот в древних белковых последовательностях, которые до появления LUCA уже успели приобрести некоторое разнообразие, очень много ароматических аминокислот — триптофана, гистидина, тирозина и фенилаланина. В то же время валин и глутаминовая кислота в малых количествах содержатся в последовательностях LUCA. История, конечно, запутанная, но зато она явственно показывает, что стандартный генетический год вовсе не появился из ниоткуда.
Читать полностью…
Красота крыльев бабочек порой просто поражает. Совершенное сочетание цветов и форм на крыльях бабочек порой кажется чем-то неземным. Однако реальность оказалась куда прозаичнее. Как нетрудно догадаться, окраска крыльев бабочек имеет генетическую подоплеку. Считалось, что четыре белка, гены которых расположены в локусе cortex, и определяют окраску крыльев. Но эксперименты по "выключению" cortex дали неоднозначные результаты. Так кто же может определять пигментацию крыльев у бабочек? Как оказалось, микроРНК mir-193 регулирует окраску крыльев у многих бабочек, более того, ее роль сохраняется и у дрозофилы. Эта микроРНК вырезается из длинной некодирующей РНК ivory и регулирует экспрессию сразу нескольких генов, связанных с пигментацией, подавляя их.
Читать полностью…
Знаете, мне вот крайне сложно работать без вдохновения. Это касается и написания текстов на этом канале. Да и вообще, тема ментального здоровья всё чаще будоражит наше общество: новости о том, как не выгорать, как заботиться о своём благополучии, как мотивировать себя и искать смыслы появляются каждую неделю. Вдохновение — это не удел не только художников, композиторов, писателей и других деятелей искусства. Вдохновение нужно и ученому. Чего уж греха таить, ученые — не роботы, а люди, и внутренняя жизнь напрямую влияет на общее состояние человека, результативность и способность работать на долгих дистанциях. Но есть и хорошая новость: моя знакомая Надежда Потапова @biomorkot придумала и сделала психологические карточки с поддержкой и мотивацией. Они специально созданы для всех, кто учится (школьники, студенты, аспиранты) и кто работает в науке и смежных интеллектуально нагруженных профессиях.
С одной стороны на них изображён рисунок, а с другой — три абзаца текста. Эти три абзаца поддержат, вдохновят, замотивируют и натолкнут на размышления. Все они написаны не только психологом, но и человеком с 12-ти летним опытом работы в науке (а такой опыт и комбо нередко можно встретить). Лично мне очень помогает перелистывание этих карточек, когда силы совсем на нуле. Надеюсь, они помогут и вам!
Ссылка на карточки: https://shop.pcr.news/goods/karty_motivatsiya_i_podderzhka/
П.С. А ещё, как меньший формат, были созданы закладки для книг, тоже с добрыми словами поддержки и вдохновения https://shop.pcr.news/goods/zakladki_zagadochnyy_mir_biologii/.
Отношения — штука сложная и тонкая, но едва ли разрыв отношений может быть вызван... плохой погодой. Но это у нас с вами так, а вот у сейшельской камышовки (Acrocephalus sechellensis) распад пары может быть спровоцирован засухой или, наоборот, избыточными дождями. Эти птицы образуют пары на несколько сезонов, однако стрессовое состояние, вызванное неблагоприятными погодными условиями, по всей видимости, и способствует распаду пар. Вот такая драматичная история.
Читать полностью…