Бластим: курсы и работа в биотехе

24 мая 2023 17:00

🔔Сегодня в 19:00 (мск) пройдет II вебинар из мини-серии по микробиомике человека!

Занятие «Обработка биобанка микробиоты: лабораторный этап» проведет Станислав Кошечкин, к.б.н.
генеральный директор Knomx, советник по науке Nobias Technologies, преподаватель курса Бластима по NGS.

До встречи на вебинаре!

Бластим: курсы и работа в биотехе

22 мая 2023 15:26

24 мая в 19:00 пройдет II вебинар «Обработка биобанка микробиоты: лабораторный этап» из мини-курса по анализу микробиома человека.

Спикером выступит Станислав Кошечкин, к.б.н., генеральный директор Knomx, Советник по науке Nobias Technologies, преподаватель курса «анализ NGS-данных» от Бластим

На занятии вы узнаете:

— Как работает метод 16S секвенирования и какие есть платформы
— Узкие места метода и зачем нужен контроль качества преаналитического и лабораторного этапов
— Практические рекомендации для обработки биобанка микробиоты

А также научитесь:

— Планировать лабораторный этап обработки биобанка микробиоты
— Теоретическим основам метода секвенирования 16S рРНК
— Оценивать техническое описание при изучении публикаций

✅Вход свободный. Записаться на вебинар можно по ссылке: bit.ly/45kjFAD

Бластим: курсы и работа в биотехе

19 мая 2023 19:05

🎓Подборка PhD-позиций за рубежом!

🇸🇪PhD-позиция в структурной биоинформатике (Швеция)
Линчепингский университет приглашает аспирантов для работы в области структурной биоинформатики и изучения биомолекулярных структур с помощью ИИ. Необходимо знание методов искусственного интеллекта и машинного обучения, а также опыт их применения в структурной биоинформатике или смежных областях, знакомство с AlphaFold, знание Python и/или C++, опыт работы с BASH и командной строкой.
Дедлайн: 26 мая
Подробнее: bit.ly/42LBJll

🇩🇪PhD-позиции в протеомику и масс-спектрометрию (Германия)
Приглашаются докторанты и постдоки в лабораторию Тензера в Университетский медицинский центр Майнцского университета для работы по клинической протеомике. Требуется опыт в ЖХ/МС, интерес к биомедицине и биомаркерам, приветствуются знания Python, R, матмоделирования.
Дедлайн: 29 мая
Подробнее: bit.ly/3Igpbu8

🇩🇰PhD-стипендиальная программа в биоинформатику и анализ данных (Дания)
На кафедру биотехнологии и биомедицины Технического университета в Копенгагене нужен PhD-студент для исследования механизмов клеточной дифференцировки. Предстоит заниматься геномикой одиночных клеток (scRNA-seq, scATAC-seq, пространственная транскриптомика) и массовых наборов данных (РНК-/ATAC-/ChIP-seq). Нужна магистерская степень в области биоинформатики, биостатистики, подтвержденный опыт анализа и интерпретации данных секвенирования отдельных клеток, настройки Nextflow, Snakemake, знание Python или R. Длительность 3 года.
Дедлайн: 2 июня
Подробнее: bit.ly/3pIUx69

🇩🇪PhD-студент в Институт физиологии (Германия)
Университетская клиника Карла Густава Каруса в Дрездене приглашает в аспирантуру в проект по изучению роли бета-клеток в гомеостазе глюкозы. Предстоит работать с животными и клеточными моделями, использовать гистологические, биохимические методы и визуализацию. От соискателей требуется степень магистра, опыт работы с животными моделями.
Дедлайн: 15 июня
Подробнее: bit.ly/3MbPzXq

🇧🇪PhD-студент в центр системной биологии растений (Бельгия)
Лаборатория Алена Гуссенса приглашает выпускников магистратуры изучать фосфопротеом при стресс-индуцируемом жасмонатном сигналинге растений. Предстоит применять передовые методы изучения белок-белковых взаимодействий, подходы метаболомики, редактирования генов и микроскопии.
Подробнее: bit.ly/3M5ZLR6

#бластим_вакансии

Бластим: курсы и работа в биотехе

18 мая 2023 10:00

Советуем канал «Инновации в фармацевтике». Там надежная и проверенная информация про доказательные подходы в медицине и фармацевтике!

Команда ученых и научных журналистов публикует топовые новости фармы в России и в мире из достоверных и авторитетных источников, следит за важнейшими открытиями в отрасли, развенчивает мифы о болезнях и методах их лечения, рассказывает о громких успехах и сокрушительных провалах препаратов ведущих производителей.

Подписчики канала уже узнали:

💊Почему Индия становится ведущим мировым фармацевтическим центром
🦻Как умный наушник поможет быстрее восстановиться после инсульта
💉Почему Merck и Eisai решили прекратить клинические исследования передовой терапии меланомы
🩸Как третий человек в мире полностью излечился от ВИЧ при помощи стволовых клеток костного мозга

Еще на канале выходят дайджесты новостей FDA — американского регулятора, который зачастую определяет судьбу лекарственных средств на мировом фармацевтическом рынке и тенденции в отрасли на годы вперед. Вот третий выпуск!

🔗Подписывайтесь на канал Chemrarpharma и будьте в курсе самых свежих новостей в индустрии

#бластим_рекомендация

Бластим: курсы и работа в биотехе

16 мая 2023 18:22

Как найти позицию, которая будет отвечать всем запросам — интересные задачи, справедливая оплата, классная команда? Бластим собирает первую виртуальную Ярмарку вакансий! Приходи и получи шанс найти идеальную работу в биотехе!

В программе:

🖥 Тематические онлайн сессии, на которых представители компаний расскажут об открытых вакансиях, условиях работы в команде, стажировках и учебных программах
🤝 Участники-соискатели смогут пообщаться с нанимающими менеджерами, задать вопросы об условиях работы и требованиях к кандидатам, а также оставить свои контакты и познакомиться с потенциальными работодателями
📝 Все презентации компаний-участниц с контактными данными будут опубликованы на платформе мероприятия и доступны после окончания Ярмарки

Кому подойдет?

🧬Мероприятие идеально для ученых, биологов, агротех-специалистов, аналитиков и всех, кто ищет работу в области биотехнологий или хочет ближе познакомиться с ведущими компаниями в индустрии

Как принять участие?

1 – Зарегистрируйтесь для участия в Ярмарке: bit.ly/3M4o8P4
2 – Следите за обновлениями на сайте и в наших социальных сетях
3 – Обновите резюме в базе Бластима
4 – Подготовьте вопросы для представителей компаний

🎪Дата и время проведения: 27 мая с 10:00 до 17:00
Сохраняйте себе во всех календариках и зовите друзей!

Бластим: курсы и работа в биотехе

15 мая 2023 18:03

17 мая в 19:00 (мск) пройдет первый вебинар «Сбор данных и биобанка: клинический этап» из мини-курса по анализу микробиома человека методом секвенирования 16S рРНК бактерий.

Спикером выступит Владимир Романов, менеджер клинических исследований компании Nobias Technologies.

На занятии вы узнаете:

🧫Чем отличается микробиомный проект от обычного клинического исследования
🧬Какое место в структуре проекта должна занимать метагеномика
📝Каким образом должны выглядеть результаты клинической части исследования микробиоты

А также научитесь:

🦠Правильно планировать микробиомное исследование
🏥Собирать клинические данные, чтобы ничего не потерять
🔬Оформлять биобанк микробиома для дальнейшего изучения в лаборатории

✅Вход свободный. Записаться на вебинар можно по ссылке: https://bit.ly/3I9VgDT
Всем, кто будет онлайн, подарим шаблон синопсиса клинического исследования!

Бластим: курсы и работа в биотехе

14 мая 2023 12:40

Наполним выходные наукой вместе с Бластимом!

🧠Стандарт терапии болезни Паркинсона — пероральный прием L-дофы. Молекула преодолевает гематоэнцефалический барьер и, метаболизируясь в дофамин, компенсирует его недостаток в мозге. Однако проблема такого лечения — постоянные колебания уровня дофы в плазме, приводящие к лекарственной дискинезии. В Nature Communications авторы предложили новый способ терапии нейродегенерации: заменить в дофаминовых нейронах инактивированную тирозингидроксилазу — фермент, превращающий дофу в нейромедиатор дофамин — на нанозим! За основу ученые взяли наночастицы железа Fe3O4, которые имитируют каталитический центр естественного фермента. Чтобы происходило распознавание субстрата, к наночастицам был присоединен нуклеотидный аптамер к тирозину. Кроме того, для эффективного прохождения ГЭБ и нацеливания именно на больные нервные клетки ученые пришили еще один аптамер — к рецептору трансферрина. И, наконец, последним к конструкции добавили антисмысловой олигонуклеотид к мРНК α-синуклеина. Он был необходим, чтобы нанозим реагировал на сверхэкспрессию ключевого маркера нейродегенерации. Проверка искусственного фермента на клеточных и мышиных моделях паркинсонизма показала отличные результаты.
https://www.nature.com/articles/s41467-023-38323-w

🧼Комары питаются нектаром и кровью. В поиске жертв кровососущие самки насекомых ориентируются на ореол летучих органических соединений, испускаемых их хозяевами. Пахучие молекулы — продукты метаболизма самих животных и их микробиоты. А в случае с людьми в дело вмешиваются еще и духи, мыла, порошки. Эти средства содержат множество соединений и часто по запаху имитируют цветочные ароматы. Американские исследователи решили проверить, как средства гигиены влияют на привлекательность человека для кровососущих. Ученые взяли 4 мыла самых популярных марок в США и жёлтолихорадочных комаров Aedes aegypti. Испытуемые носили нейлоновые нарукавники, после чего пробы воздуха вокруг повязок анализировались с помощью ГХ-МС. Также оценивали притягательность запаха для комаров по числу посадок на нарукавники. Мыла действительно влияли на привлечение кровососов: после мытья рук происходил сдвиг в профиле запаха человека в пользу химических веществ растительного происхождения. Кроме того, специалистам удалось идентифицировать, какие именно соединения привлекают комаров. Но, конечно, куда любопытнее узнать о репеллентах: отталкивают кровососов бензилбензоат (компонент аромата цветов, используемый в лечении педикулеза), γ-ноналактон (аромат арбуза) и бензальдегид (запах миндаля).
https://www.cell.com/iscience/fulltext/S2589-0042(23)00744-7

🌍Пшеница, рис и кукуруза — три кита, на которых держится все сельское хозяйство. Однако чрезмерная зависимость от нескольких зерновых не обеспечивает продовольственную безопасность. Сегодня ученые присматриваются к так называемым «сиротским» культурам, имеющим региональное значение, но не представленным в мировой сельхозпрактике. Африка — кладезь таких перспективных видов, но пока местная наука испытывает проблемы с современным оборудованием для изучения генетических ресурсов. На этот раз в коллаборации с западными коллегами африканские ученые занялись лаблабом. Это бобовое растение выращивается в тропиках, где активно используется в пищу и на корм скоту. Лаблаб питателен и засухоустойчив. Генетики, используя недорогие портативные платформы для секвенирования с длинными ридами, прочитали геном лаблаба. Они определили расположение локусов важных агрономических признаков, а также кластеров нежелательных генов ингибиторов трипсина, изучили мобилом, установили два события одомашнивания. Новые данные позволят вести эффективную геномную селекцию, в частности на уменьшение антипитательных свойств при сохранении высокого адаптивного потенциала.
https://www.nature.com/articles/s41467-023-37489-7

#выходные_у_бластим

Бластим: курсы и работа в биотехе

11 мая 2023 17:57

⚡️Вебинар «Начни программировать на Python: возможности для биологов» стартует через пару минут!
Все, кто хочет попасть на эфир, еще могут успеть получить ссылку.
Регистрируйтесь прямо сейчас: bit.ly/3LT5KIV

Бластим: курсы и работа в биотехе

10 мая 2023 18:55

Меньше, чем через неделю, стартует «Python для новичков», и нас очень много спрашивают про организацию и программу курса. На карточках мы собрали ответы на самые популярные вопросы.

⚡Если вы хотите больше узнать о возможностях питона для биологов, приходите завтра на наш вебинар в 19.00 по МСК. Вход свободный, регистрация по ссылке: bit.ly/3BjRO5C

#бластим_питон

Бластим: курсы и работа в биотехе

05 мая 2023 17:01

Нам часто задают вопрос, можно ли устроиться на стажировку или работу после наших курсов. Короткий ответ: очень вероятно, что да. Но конечно же, многое зависит от соискателя, от умения себя подать в резюме, а также от типа вакансии. Для вашего удобства подобрали несколько хороших вариантов для биоинформатиков. Надеемся, каждый найдет себе по душе.

🇵🇱Оплачиваемая стажировка по биоинформатике в Ardigen (Краков, Польша)
На стажировке предстоит оказывать биоинформатическую поддержку приложений для персонализированной терапии рака. Требования к соискателям: нужно быть студентом магистратуры или выпускником в области биоинформатики/молбиологии/биотехнологии/информатики или смежных, иметь базовое понимание рабочих процессов анализа NGS-данных, а также навыки на Python. Формат гибридный.
Дедлайн: 29 мая
bit.ly/3AYCtYo

🇩🇪PhD-студент в институт Роберт Коха (Бранденбург, Германия)
Приглашаются кандидаты со степенью магистра для работы и написания диссертации в области ИИ в здравоохранении. Требуется опыт количественного анализа сложных массивов данных с использованием Python или Java. Приветствуются знания в сфере ИИ.
Дедлайн: 30 мая
bit.ly/41odM2l

🇱🇺Разработчик ПО в Центр Системной Медицины (Люксембург)
Предстоит создать платформу для управления и анализа данных пациентов. Необходима степень магистра, в идеале в области, связанной с IT, отличное знание Python или Java, а также 4+ лет опыта в качестве разработчика.
Дедлайн: 2 июня
bit.ly/42eQpJO

🇳🇴Постдок в биоинформатику в Институт исследования рака (Осло, Норвегия)
Приглашается биоинформатик в проект по изучению роли регуляторных Т-клеток в микроокружении опухоли путем scRNA-seq, пространственной транскриптомики и протеомики. Нужна степень PhD в области биоинформатики, вычислительной биологии, информатики и смежных, знание Linux, а также Python и R, основ ML, опыт анализа и интеграции мультиомных данных.
Дедлайн: 13 июня
bit.ly/413jzKt

🇺🇸Старший менеджер в протеомику в Freenome (Калифорния, США)
Freenome занимается онкодиагностикой по биомаркерам крови. В стартап требуется менеджер для поддержания мультиомиксной платформы. От соискателя нужна PhD-степень в области биоинформатики, опыт в постановке экспериментов в протеомике с использованием Python/R, навыки руководства коллективом, знания статистики.
bit.ly/3LWqOj0

🇧🇪Биоинформатик в Orionis Biosciences (Гент, Бельгия)
Стартап создает платформу для скрининга новых лекарств против рака. От кандидата: степень бакалавра в области биоинформатики, наук о жизни, информатики или прикладной математики. Нужны продвинутые навыки программирования (Python) и опыт работы с базами данных (PostgreSQL), AWS и Docker.
bit.ly/416E7li

🇩🇪Стажер в вычислительную биологию в Dewpoint (Дрезден, Германия)
Разыскивается стажер, который присоединится к команде генетиков и вычислительных биологов. Предстоит применять мультиомные данные к разработке лекарств. Стажеры будут изучать концепции датасайнс в биоинформатике. Нужна степень магистра, хорошее знание статистики, опыт в R или Python.
bit.ly/3HDUmz5

🇩🇪Стажировка в KWS (Айнбек, Германия)
KWS — компания по селекции растений — приглашает бакалавров и магистров на оплачиваемую стажировку. Предстоит проводить молекулярные исследования в лабораториях по разным направлениям, в том числе биоинформатике.
bit.ly/3HDQEG0

🇫🇷Стажировка по машинному обучению в Owkin (Париж, Франция)
Owkin — биотех-стартап, который применяет искусственный интеллект для разработки новых лекарств. Компания приглашает на стажировку, которая будет посвящена приложению федеративного обучения к генетическим данным. Нужен опыт работы в ML, навыки в Linux/Unix и Python, а также знание фреймворков DL (Tensorflow, PyTorch).
bit.ly/3AXnX2V

#бластим_подборка

Бластим: курсы и работа в биотехе

04 мая 2023 08:49

«Геномед» — это инновационная компания с командой врачей-генетиков и неврологов, акушеров-гинекологов и онкологов, биоинформатиков и лабораторных специалистов, предоставляющая комплексную и высокоточную диагностику наследственных заболеваний, нарушений репродуктивной функции, подбор индивидуальной терапии в онкологии.

Компания в сотрудничестве с мировыми лидерами в области молекулярной диагностики предлагает более 200 молекулярно-генетических исследований, основанных на самых современных технологиях. Использование секвенирования нового поколения, микроматричного анализа с мощными методами биоинформатического анализа позволяют быстро поставить диагноз и подобрать правильное лечение даже в самых сложных случаях.

Миссия «Геномеда» заключается в предоставлении врачам и пациентам комплексных и экономически эффективных генетических исследований, информационной и консультационной поддержки 24 часа в сутки.

В команду «Геномеда» требуется руководитель R&D-отдела.

Обязанности:
🔸Ведение проектов R&D и управление ими, планирование работы R&D, руководство отделом R&D, построение команды;
🔸Организация и участие в разработке тест-систем для ДНК(РНК)-диагностики (на основе NGS/Microarray), их внедрение в работу лаборатории и валидация;
🔸Решение нетривиальных задач, возникающих в ходе рутинной диагностики;
🔸Участие в процессе внедрения новых методов и оборудования в рутинную работу лаборатории, поиск новых решений;
🔸Отчетность перед руководством.

Требования:
🔺Опыт работы в области молекулярной биологии/генетики не менее 3 лет;
🔺Опыт работы в проектах/команде R&D;
🔺Наличие управленческих/организационных навыков;
🔺Систематический подход к ведению работы;
🔺Готовность работать в команде.

Условия:
🔹Работа в лидирующей компании в области генетических исследований;
🔹Стабильная заработная плата, оформление согласно ТК РФ;
🔹Место работы: Короленко, д. 8, метро «Сокольники»;
🔹Возможность освоения современных диагностических методов;
🔹Возможность участия в научных проектах и разработках.

Откликнуться на вакансию: bit.ly/3NDNkP0

#бластим_вакансии

Бластим: курсы и работа в биотехе

03 мая 2023 10:33

Поздравляем с праздниками и анонсируем розыгрыш призов!

Сегодня последний День Открытых дверей, мы собираем заявки и разыгрываем скидки среди тех, кто зарегистрируется до 12:30 (мск).

Уже почти 400 человек получили бесплатный доступ к избранным лекциям наших курсов (всего 106 часов) и примут участие в лотерее, где можно выиграть выгодные скидки на предстоящие программы! Никто не уйдет без подарка!

Совсем скоро пройдет розыгрыш призовых скидок, спешите присоединиться к акции: bit.ly/3HyifIl
Промокоды будут действовать до пятницы.

Бластим: курсы и работа в биотехе

30 апреля 2023 15:12

Свежая порция новостей науки от Бластима для чтения на выходных!

🌱Карликовые и полукарликовые сорта пшеницы с подавленным гибберелиновым сигналингом устойчивы к полеганию и во многом обеспечили Зеленую революцию 1960-х. Однако нарушение фитогормонального баланса не проходит даром: растения с коротким стеблем имеют низкую эффективность усвоения азота и фиксации углерода, что приводит к снижению биомассы, размера колоса и веса зерна. Для поддержания высокой урожайности необходимо обильное азотное питание. Это требует внесения большого количества удобрений, что наносит ущерб окружающей среде. На этот раз ученые решили пойти иным путем и сделать редизайн полукарликовых сортов пшеницы без использования традиционных аллелей зеленой революции. Специалисты использовали природных мутантов с редкой делецией генов восприятия других гормонов — брассиностероидов, которые также вовлечены в контроль многих агрономических признаков. Им удалось получить компактные растения с куда лучшей урожайностью. Генетики предлагают получать такие короткостебельные сорта пшеницы и прочих зерновых для сельского хозяйства с помощью CRISPR-Cas9!
Подробнее: https://www.nature.com/articles/s41586-023-06023-6

🐸Некоторые виды, например, ядовитые лягушки-древолазы, предпочитают не прятаться от хищников, а отпугивать их предостерегающей окраской. Это называется апосематизмом, и проблема развития такой адаптивной стратегии давно беспокоит биологов. Действительно, как в популяции может закрепиться признак вызывающей окраски, если первая же особь-мутант станет легкой мишенью для хищников, которые не могут сразу распознать ее несъедобность или ядовитость? Статья в Science как раз на примере амфибий описывает эволюционную траекторию перехода от камуфляжной окраски к пестрой. Канадские и южнокорейские исследователи предполагают, что существуют промежуточные этапы между маскировкой к апосематизмом. В переходном состоянии демонстрация предупреждающего окраса хищникам происходит при непосредственном контакте, поскольку у таких земноводных с химзащитой ярко окрашены только конечности или брюхо.
Подробнее: https://www.science.org/doi/10.1126/science.ade5156

🍴Нервная анорексия — серьезное расстройство пищевого поведения. Несмотря на высокую летальность, пока заболевание описано как набор симптомов, а его этиология неясна. Известно, что в патогенезе участвуют как средовые факторы, так и генетика. В материале в Nature Microbiology датские ученые с помощью метагеномики фекальной микробиоты и метаболомики крови изучили, какую роль играют микробиом и виром кишечника в развитии болезни. Им удалось показать что кишечные микробы через метаболиты крови способны влиять на процессы контроля мозгом аппетита, эмоций и поведения. Например, бактерии у женщин с нервной анорексией производят меньше витамина B1, дефицит которого связан с психофизиологическими нарушениям. Кроме того, микробиом пациенток был обогащен биохимическими путями деградации нейромедиаторов. А в сыворотке крови оказалось повышено количество соединений, связанных с регуляцией насыщения: желчных кислот и производных триптофана. Роль бактерий в патогенезе анорексии подтвердилась и в экспериментах с трансплантацией фекальной микробиоты человека мышам.
Подробнее: https://www.nature.com/articles/s41564-023-01355-5

Кстати, напоминаем, что в мае у Бластима пройдет серия вебинаров по микробиомике человека. Записывайтесь: bit.ly/3LGVkNC

#выходные_у_бластим

Бластим: курсы и работа в биотехе

27 апреля 2023 17:18

На прошлой неделе мы рассматривали гибридомную технологию для наработки терапевтических антител. А в сегодняшнем посте кратко разберем альтернативный подход для получения иммуноглобулинов — фаговый дисплей.

🎯Дисплейные методы, как и метод гибридóм, начинаются с иммунизации животного. Этот этап нужен, чтобы получить антитела, из которых затем мы будем выбирать лучшее. Однако, в отличие от ограниченного набора антител-кандидатов в методе гибридóм, с помощью дисплейных методов можно «перебрать» сразу миллиарды последовательностей потенциальных антител.

🦠Самым популярным из всех дисплейных методов считается фаговый дисплей. Он заключается в том, чтобы «заставить» бактериофаг М13 выставлять на своей поверхности (от англ. display — отсюда название метода) фрагменты антитела. Каждый отдельный бактериофаг представляет последовательность только одного антитела, а в одной пробирке таких вирусных частиц могут быть миллиарды. Такие масштабы достигаются за счет высокопроизводительных методов молекулярного клонирования. Затем, в результате нескольких раундов селекции, из миллиардов потенциальных последовательностей отбирают единственный кандидат, который станет будущим антителом.

🐭Главное преимущество фагового дисплея — в огромном разнообразии молекул-кандидатов: в одном раунде удается «прогнать» миллиарды последовательностей. Также среди плюсов, которые отличают фаговый дисплей от метода гибридóм, стоит отметить возможность работы с полностью человеческими (а не мышиными) последовательностями, а также меньшие затраты времени — не нужно иммунизировать мышей, выделять из них В-лимфоциты и скрещивать их с клетками миеломы. В этом же кроется, пожалуй, и главный недостаток: фаговый дисплей — слишком искусственная система. На выходе мы получаем «огрызки» молекул — всего лишь вариабельные фрагменты, а не полноразмерные антитела. Не факт, что даже идеально связавшийся фрагмент-кандидат сможет наработаться в клетках.

💊Но, несмотря на свои ограничения, метод фагового дисплея остается очень популярным для получения моноклональных антител во многих фармацевтических компаниях. Если отработать лабораторный процесс до автоматизма, можно анализировать потенциальные антитела намного быстрее, чем с помощью гибридóм.

#бластим_технологии
#бластим_фарма

Бластим: курсы и работа в биотехе

26 апреля 2023 13:11

Планируйте май и лето вместе с Бластимом!

🦠 Вебинары

Бластим x Knomx x Nobias Technologies представляют серию вебинаров об особенностях проведения исследований микробиоты человека методом секвенирования 16S рРНК. В рамках занятий вы получите практические рекомендации по проведению микробиомных исследований от стадии планирования до анализа данных.

17 мая — Сбор данных и биобанка: клинический этап.
Спикер: Владимир Романов

24 мая — Обработка биобанка микробиоты: лабораторный этап.
Спикер: Станислав Кошечкин

31 мая — Обработка данных: биоинформатика и статистика.
Спикер: Вера Одинцова

Зарегистрироваться на вебинары: bit.ly/3n5pT6e

🎓 Курсы

Запись открыта:

🆕 Python для анализа данных в науке
Освоим популярный язык программирования с нуля для решения большинства задач в датасайнс и биоинформатике. Старт 16 мая
Регистрируйтесь сейчас со скидкой: bit.ly/44fUizw

📌 Анализ NGS-данных
Летний поток курса по основным разделам NGS с качественной практикой. Старт 26 июня
Записаться: bit.ly/41I6l74

🆕 ML на Python для решения биоинформатических задач
Курс по основам машинного обучения для применения в своих исследованиях. Старт 29 августа
Узнать подробности: bit.ly/41Xanbo

Можно предзаписаться:

📌 Анализ данных РНК-секвенирования
Интенсив по анализу транскриптомов: bit.ly/40FGZ8j

Сохраняйте и шерьте!

#бластим_курсы

Бластим: курсы и работа в биотехе

24 мая 2023 11:55

Биология — увлекательная область с множеством карьерных возможностей. Предлагаем обсудить несколько вариантов траекторий в лайфсайнс. Рассмотрим плюсы/минусы позиций, места, где можно работать, среднюю зарплату в США и Европе.

#бластим_карьера

Бластим: курсы и работа в биотехе

21 мая 2023 19:07

Удивительные новости науки этой недели в обзоре Бластима!

🦋Бабочки издавна привлекают внимание не только энтомологов-любителей, но и многочисленных ученых-натуралистов. Удивительно, что эволюционная история излюбленного объекта исследования и коллекционирования стала понятна буквально недавно. 15 мая в Nature Ecology & Evolution была опубликована статья по филогении чешуекрылых. Специалисты секвенировали 391 ген почти 2300 видов бабочек, охватывающих 92% современных родов, и получили крайне любопытные результаты. Подтвердилось, что чешуекрылые эволюционировали вместе с покрытосеменными растениями, хотя и возникли на 100 млн лет позже цветковых. Выяснилось также, что бабочки произошли от предков ночных травоядных мотыльков в верхнем мелу на территории современной Северной Америки. Позже, примерно 75 млн лет назад, бабочки заселили Евразию, а затем произошла их значительная диверсификация в тропических регионах. Кроме того, сопоставив многочисленные источники, ученые предположи, что гусеницы последнего общего предка бабочек питались бобовыми растениями. Сегодня также почти 70% чешуекрылых — «однолюбы», которые предпочитают только травы семейств бобовые или злаковые, с которыми они коэволюционируют вот уже миллионы лет!
https://www.nature.com/articles/s41559-023-02041-9

🧬Все-таки гребневики оказались сестринской группой по отношению ко всем остальным многоклеточным животным! К такому выводу пришли ученые в новой статье в Nature. Гребневики — организмы, внешне похожие на медуз, но отнюдь им не родственные. А еще есть губки, скажем, всем известная бадяга. Зоологи много лет дискутируют, кто дивергировал раньше всех из ветви Metazoa: примитивные губки или более продвинутые гребневики? Традиционные филогенетические подходы в этом вопросе себя исчерпали, поэтому было решено построить дерево по синтении — консервативному набору и порядку расположения генов на хромосоме. Ученые взяли геномы представителей стрекающих, губок, пластинчатых, билатерий и гребневиков, а в качестве аутгрупп добавили одноклеточных родственников животных (хоанофлагеллят и др.). Несмотря на миллионы лет независимой эволюции, губок, пластинчатых, стрекающих и билатерий объединяют уникальные хромосомные перестройки, которые отсутствуют у гребневиков. Это свидетельствует о том, что именно гребневики — самая первая группа, ответвившаяся от общего ствола животных. Результаты работы имеют принципиальное значение, особенно для понимания становления нервной системы.
https://www.nature.com/articles/s41586-023-05936-6

🧪Растворитель трихлорэтилен (ТХЭ) повысил риск развития паркинсонизма у группы американских ветеранов морской пехоты на 70%. Дело в том, что эти военные в 1970-80-е годы тренировались на базе Лежен в Северной Каролине, где вода была значительно загрязнена трихлорэтиленом. В литературе давно звучали подозрения об опасности молекулы, но сейчас, изучив 85 тыс. медкарт, эпидемиологи показали достаточно четкую связь между растворителем и болезнью Паркинсона. ТХЭ — легко летучая бесцветная жидкость, очень устойчивая в воде и почве. В прошлом вещество пользовалось популярностью в промышленности, применялось в химчистке, для приготовления кофе и даже анестезии. По-видимому, морпехи могли вдыхать соединение, получать его трансдермально или с пищей во время учений, ведь в воде на базе Лежен уровень ТХЭ превышал допустимый в 70 раз! Ранее нейротоксикологи на животных показали патомеханизм ТХЭ: химикат легко всасывается через кожу, проходит биомембраны и ингибирует митохондриальный комплекс I в дофаминовых нейронах мозга, что приводит к их гибели.
https://www.science.org/content/article/widely-used-chemical-strongly-linked-parkinson-s-disease

#выходные_у_бластим

Бластим: курсы и работа в биотехе

18 мая 2023 15:05

В новой статье про современные технологии откроем для себя метод DISCOVER-Seq+. Он позволяет с высокой точностью искать офф-таргеты «генетических ножниц» CRISPR/Cas9!

#бластим_технологии

Бластим: курсы и работа в биотехе

17 мая 2023 15:05

Сегодня стартует мини-курс «Исследования микробиома человека — руководство пользователя».
В 19:00 (мск) пройдет первое занятие «Сбор данных и биобанка: клинический этап». Спикер: Владимир Романов.

⭐Успейте записаться прямо сейчас и попасть на полезный вебинар: bit.ly/41Mj1bY

Бластим: курсы и работа в биотехе

16 мая 2023 12:50

🕵🏻‍♂Разыскивается опытный технишн в Клонинг Фасилити!

Биотех-компания в области промышленной биотехнологии микроорганизмов ищет в команду коллегу для помощи с технической частью, требующей хороших навыков молекулярно-биологической работы, аккуратности и готовности адаптировать и улучшать новые протоколы.

Требования:
✔Обязателен опыт ежедневной работы в молекулярно-биологической лаборатории в течение нескольких лет
✔Идеальный кандидат любит оптимизировать свои работу, не боится пробовать новое, уверенно владеет базовыми методами молекулярной биологии, легко читает на английском

Условия:
▫Работа в одной из самых сильных команд в отрасли
▫Место работы: Москва, территория ИБХ РАН (м. Беляево)
▫Рыночная зарплата, определяемая в зависимости от опыта и по результатам собеседования
▫Карьерный рост и увеличение зарплаты по мере профессионального роста
▫Испытательный срок: 3 месяца
▫Оформление в штат по ТК РФ

❗Заявки принимаются до 15 июня
Ссылка на анкету: bit.ly/3IfztdV

#бластим_вакансии

Бластим: курсы и работа в биотехе

15 мая 2023 12:19

Бластим рекомендует научную школу от ПИШ ИТМО AGNI Workshop Week!🔥

AWW – первый формат научной школы по формуле: 1 неделя – 1 проект, где на одной площадке собираются участники из абсолютно разных областей естественных наук со всей России!

В рамках воркшопа участники подготовят свой проект по одному из трех треков, узнают о перспективных направлениях нанотехнологий, улучшат soft skills и познакомятся с коллегами по сфере.

Конкурсантам, прошедшим отбор, предоставляется бесплатное проживание и участие. Помимо этого, можно поучаствовать в конкурсе на бесплатный перелет!

Подробнее читайте в карточках и не упустите возможность подать заявку на лучшую неделю этого лета:
🔗 http://aww.itmo-agni.ru/

❗Дедлайн: 17 мая

#бластим_рекомендует

Бластим: курсы и работа в биотехе

12 мая 2023 13:35

Подготовили для вас обзор приложений искусственного интеллекта в прикладных сферах от сельского хозяйства до медицины и фармы в новом материале Бластима. Обсудим, как машинное обучение, нейросети и компьютерное зрение нашли себя в биотехе.

#бластим_технологии

Бластим: курсы и работа в биотехе

11 мая 2023 14:30

Собрали воедино отличные мероприятия в науке и индустрии!

📌Всероссийская школа-конференция «Сохранение и преумножение генетических ресурсов микроорганизмов» (Санкт-Петебург)
26 — 27 июня
Дедлайн: 12 мая
bit.ly/41qWilU

📌Съезд Российского Физиологического Общества им. И.П. Павлова (Санкт-Петебург)
11 — 15 сентября
Дедлайн: 12 мая
bit.ly/3BdVwxU

📌Школа по Магнитно-Резонансной Томографии (Санкт-Петербург)
3 — 8 июля
Дедлайн: 14 мая
bit.ly/3nRcj6S

📌Мини-курс «Исследования микробиома человека — руководство пользователя» (онлайн)
17, 24, 31 мая
bit.ly/3O6s58J

📌Вебинар «Руководство для начинающих по интерпретации результатов биостатистики»
23 мая, 14:00 (мск)
bit.ly/41sxVEb

📌Виртуальная Ярмарка вакансий в биотехе
27 мая
bit.ly/42P9pyn

📌Съезд Общества физиологов растений «Биология растений в эпоху глобальных изменений климата» (Уфа)
18 — 23 сентября
Дедлайн: 31 мая
bit.ly/3O0fIL2

📌Конференция «Современные проблемы фотобиологии» (Краснодарский край и дистанционно)
10 — 17 сентября
Дедлайн: 1 июня
bit.ly/3MjF2L5

📌Международная научная конференция молодых учёных и специалистов, посвящённая 180-летию со дня рождения К.А. Тимирязева (Москва и дистанционно)
5 — 7 июня
Дедлайн: 3 июня
bit.ly/3I0MMPx

📌Всероссийская школа-конференция «Коллекции культур клеток человека и животных: современные вызовы и сетевые решения» (Санкт-Петербург)
22 — 23 июня
Дедлайн: 5 июня
bit.ly/42sIw3d

📌Международная онлайн-конференция по сельскому хозяйству IOCAG2023
1 — 15 ноября
Дедлайн: 26 июня
bit.ly/3O13sdu

📌Конференция «Геномика, метагеномика и молекулярная биология микроорганизмов» (Сколково)
23 — 24 сентября
Дедлайн: 1 августа
bit.ly/3O1rSng

📌Летняя школа по тропическим и инфекционным заболеваниям (Бразилия)
31 июля — 18 августа
bit.ly/42ILv7w

📌Всероссийская GMP-конференция (Екатеринбург и дистанционно)
27 — 29 сентября
bit.ly/42sjXDB

#бластим_подборка

Бластим: курсы и работа в биотехе

07 мая 2023 14:38

Погружаемся в новости лайфсайнс вместе с Бластимом!

🧬22 ноября 2022 года FDA одобрило Hemgenix — первую генную терапию гемофилии B. Стоимость лечения в 3,5 млн долларов сделало препарат самым дорогим в мире. На страницах Nature авторы как раз анализируют вопрос доступности передовой терапии. Создание и производство таких лекарств обходится дороже, чем традиционных малых молекул, а ценник за лечение одного пациента может исчисляться миллионами долларов, если учитывать затраты на госпитализацию и манипуляции с клетками. Правда, некоторые специалисты считают, что генотерапия все равно выгодна, так как позволяет сэкономить на повторном лечении. Тем не менее даже в богатых странах системы здравоохранения не справляются с такими расходами. Удешевить лечение, по мнению авторов, может терапия in vivo, то есть без извлечения клеток из тела. Другой вариант — разработка платформ генной терапии: доказав безопасность и эффективность одной системы, специалисты могли бы заменять гены в отработанной конструкции под другие болезни. Успешность преодоления проблемы ценообразования определит будущее генотерапевтических препаратов.
https://www.nature.com/articles/d41586-023-01389-z

💉В пандемию COVID-19, которую ВОЗ недавно объявила оконченной, мРНК-вакцины против коронавируса из-за риска деградации компонентов приходилось постоянно держать в холодильнике. Избавиться от недостатков таких вакцин ученые из Baidu Research решили с помощью искусственного интеллекта. Применив алгоритм компьютерной лингвистики LinearDesign к нуклеотидной последовательности РНК, они провели оптимизацию кодонов для учета предпочтения клеток и повышения устойчивости молекул. Как известно, чем стабильнее мРНК, доставляемая в клетки, тем сильнее экспрессия антигенного белка и выработка в ответ на него антител, что в свою очередь усиливает иммунную защиту. ИИ легко подобрал РНК с жесткими двуцепочечными участками, которые в ходе валидационных испытаний на мышах вызвали иммунный ответ в 128 раз выше, чем традиционные вакцины! Алгоритм также увеличил сохранность препарата. Надеемся поскорее увидеть новые вакцины в клинике.
https://www.nature.com/articles/d41586-023-01487-y

☀️Чтобы повысить урожайность сельскохозяйственных культур, нужно сделать фотосинтез более эффективным. Узкое место процесса — это свойства основного фермента карбоксилирования Rubisco. У энзима низкая скорость реакций, а также он часто фиксирует кислород вместо CO2, из-за чего много энергии растрачивается на бесполезное фотодыхание. Некоторые растения, скажем, кукуруза или сахарный тростник, решают эту проблему, переходя на С4-фотосинтез. Но есть и другие механизмы концентрирования углекислоты, например, карбоксисомы. Эти специальные органеллы, где Rubisco инкапсулирован в полиэдрические белковые оболочки, характерны для микроорганизмов. Ученые решили перенести гены карбоксисом из бактерий в хлоропласты. Так, методами генной инженерии был получен транспластомный табак. В его пластидах действительно происходила самосборка функциональных карбоксисом, которые даже поддерживали фотосинтез и рост растений, но только при ненормально высокой концентрации углекислого газа. Хотя результаты свидетельствуют о необходимости оптимизации дизайна внедряемой генетической конструкции, «карбоксисомная инженерия» сулит большие перспективы для агротеха!
https://www.nature.com/articles/s41467-023-37490-0

#выходные_у_бластим

Бластим: курсы и работа в биотехе

04 мая 2023 17:50

Как биологу использовать Python для анализа больших данных? Почему этот язык становится мастхэвом для ученых? Может ли умение кодить способствовать профессиональному росту?

Эти и многие другие вопросы обсудим на открытой встрече «Начни программировать на Python: возможности для биологов». Спикером выступит опытный преподаватель программирования и матмоделирования Александр Ильин.

Программа онлайн-лекции:

• Обзор инструментов для упрощения работы в науке: автоматизация/визуализация/машинное обучение/интеграция питона с R, MATLAB, Cytoscape
• Примеры wow-эффектов от использования Python для рутинной работы в лайфсайнс
• Частые проблемы, которые возникают при работе с Python, и будущие возможности
• Грамотный трек изучения языка для новичка
• Презентация нового курса «Python для анализа данных в науке» от Бластим и ответы на все вопросы

Ждем всех желающих начать познавать насущный питон!
До встречи 11 мая в 19:00 (мск).
Регистрация по ссылке: bit.ly/3LCIazU

#бластим_питон

Бластим: курсы и работа в биотехе

03 мая 2023 16:26

Бластим провел розыгрыш призов: смотрите результаты на видео!

Теперь на почту каждому участнику придут промокоды со скидкой, которую можно реализовать на грядущие курсы Бластима. Промокоды работают до 5 мая, скидка не аддитивная.

Поздравляем всех! Это был лучший ДОД!

Бластим: курсы и работа в биотехе

02 мая 2023 12:50

Вакансия химика-лаборанта в Клонинг Фасилити!

Клонинг Фасилити — российская компания, занимающаяся промышленной биотехнологией микроорганизмов. В сильную и дружную команду нужен коллега для помощи с технической работой, требующей базовых лабораторных навыков и аккуратности.

Требования:
⚗️Образование: биологическое или химическое (возможно неполное)
🌡Базовое знание органической химии и биохимии
☢️Понимание работы в лаборатории и техники безопасности
🧪Знание аналитической химии
✍️Усидчивость и сконцентрированность

Условия:
💰Зарплата от 50 000 р. на руки
📍Лаборатория в Москве на территории ИБХ РАН
📈Карьерный рост и увеличение зарплаты по мере профессионального роста
📆Испытательный срок: 3 месяца
📔Оформление в штат по Трудовому Кодексу РФ

Заявки до 15 июня (включительно)
Откликнуться: bit.ly/3Nv6u9n

#бластим_вакансии

Бластим: курсы и работа в биотехе

28 апреля 2023 17:25

Впереди длинные выходные и мы с командой решили добавить к ленивым каникулам чуточку пользы!

С 29 апреля по 3 мая Бластим проводит День Открытых Дверей. Каждый сможет посмотреть избранные лекции самых популярных курсов (всего 106 часов):

📑Пакет для карьеры за рубежом (3 лекции)
🐧Введение в Linux (3 дня)
📊Статистика, R и анализ данных (3 дня)
💻Анализ NGS-данных (3 дня)
🧬Анализ РНК-секвенирования (2 лекции)
💊Из исследований в разработку фармпрепаратов (3 дня)

Среди бесплатных материалов будут подсказки по биологии и полезные гайды по программированию.

А еще можно поучаствовать беспроигрышной лотерее и получить одну из скидок в списке:

✨Скидка 10% на любой из курсов Бластим
💫Скидка 20% на любой из курсов Бластим
⭐Скидка 30% на любой из курсов Бластим
🔥Скидка 50% на курс «Анализ NGS-данных»
⚡Скидка 50% на курс «ML на Python для решения биоинформатических задач»
💥Скидка 80% на курс «Python для анализа данных в науке»

Регистрируйтесь сами и зовите друзей: bit.ly/4212SzW

Бластим: курсы и работа в биотехе

26 апреля 2023 18:55

#бластим_рекомендует

🧬 Уважаемые студенты, аспиранты и молодые ученые!

⚡Приглашаем Вас принять участие в научной конференции молодых ученых биотехнологов, молекулярных биологов, вирусологов, биофизиков и биоинформатиков, которая состоится в рамках Площадки открытых коммуникаций OpenBio, 26-28 сентября 2023 г. в наукограде Кольцово.

Секции конференции:
26.09 — вирусология;
26.09 — биоинформатика;
27.09 — биотехнология;
27.09 — биофизика;
28.09 — молекулярная биология.

◾К участию приглашаются ученые до 35 лет включительно;
◾Отбор осуществляется на основе тезисов;
◾Если у Вас нет возможности присутствовать лично, то организаторы обеспечат онлайн-включение. Возможно заочное участие с публикацией и выступление онлайн;
◾Отобранные тезисы будут опубликованы в сборнике конференции, размещенном в научной электронной библиотеке eLIBRARY с индексацией в РИНЦ и присвоением DOI каждому тезису.

⚡Тезисы принимаются до 1 августа

Ссылка на информацию о конференции и других мероприятиях OpenBio: https://www.openbio.ru/

Бластим: курсы и работа в биотехе

25 апреля 2023 19:33

🧬Отметим день ДНК отличной вакансией в молекулярной биологии!

Клонинг Фасилити — российская компания, которая создает инновации в области генной инженерии и синтетической биологии. Команда ищет старшего научного сотрудника с опытом работы и достижениями в молекулярной биологии.

Требования:

—Обязательно наличие научных статей.
—Идеальный кандидат любит глубоко вникать в научную литературу, не боится пробовать новое, владеет основными молекулярно-биологическими методами и английским на уровне чтения. Если что-то из этого не про вас, все равно стоит подавать заявку!

Условия:

—Работа в одной из самых сильных команд, занимающихся промышленной биотехнологией микроорганизмов.
—Лаборатория на территории ИБХ РАН.
—Рыночная з/п в зависимости от опыта и по результатам собеседования.
—Карьерный рост и увеличение з/п по мере профессионального роста.
—Испытательный срок 3 месяца. Оформление по ТК РФ.

Дедлайн: 1 мая

Если вакансия вас заинтересовала, пройдите по ссылке и ответьте на вопросы анкеты: bit.ly/3n6AJcc