❤️ Как отзывается NGS в сердцах наших студентов?

Куратор курсов Бластим Регина взяла интервью у трех очень классных слушательниц предыдущих потоков «Анализа NGS данных» и спросила, как им занятия, атмосфера и преподаватели. До начала обучения все девушки находились на разных уровнях погруженности в биоинформатику, но впечатления и эмоции от программы у всех сложились одинаковые. Какие же? Узнайте из видео

Итак, первый ролик: прохождение курса почти с нуля. Врач КЛД Алина Кузьмина поделилась своим отзывом об анализе NGS-данных в Бластим ❤️

Смотрим вместе!

Читать полностью…

Сегодня мы хотим поздравить тех, кто строит науку и иногда теряет в ней сон, — аспирантов, с Днем аспиранта 🥳

В такой день особенно хочется напомнить: многие в Бластим тоже прошли через все этапы научной агонии. Поэтому чтобы попасть в нашу «секту» — клуб выпускников, преподавателей и организаторской команды Бластим — нужно разделять и определенные личные ценности. Какие? Давайте разберемся.

📍 Поддержка — наше всё
Быть аспирантом — это как играть в тетрис, где на тебя одновременно падают дедлайны, статьи и лабораторные задачи. Хотите присоединиться или обучаетесь на нашем курсе, но испытываете финансовые, временные или психологические ограничения? Не вопрос — у нас всегда найдутся промокоды на скидки и добрые кураторы, которые готовы не просто посочувствовать, но и подсказать, как справиться. Они — настоящие супергерои и могут продлить дедлайн по домашкам, подсказать, как побороть творческий кризис, или даже просто выслушать. А еще мы часто идем дальше заявленной программы: организуем неожиданные бонусные лекции, проводим встречи с карьерными коучами и раздаем индивидуальные консультации. И нет, это не сказка — это забота 🙌

📍 Внимание к каждому
На наши курсы можно приходить со своими данными и учиться хардскиллам прямо на них. Наша команда преподавателей и ассистентов так погружается в вашу работу, что диплом или диссертация начинает писать себя сама. Многие выпускники курсов говорят, что Бластим консультировал и копался в их данных больше, чем научник 😱

Бывает, что на курсе кто-то вообще ничего не понимает. Однажды мы оплатили дополнительные часы индивидуальной помощи по программированию, чтобы студент не отстал. Или приглашали переслушать курс со следующим потоком, если жизнь внезапно ударила под дых.

Наш принцип: успех каждого студента — это наша личная победа. Поэтому мы не боимся идти навстречу, будь то совет, скидка или просто дружеская поддержка 🤝

📍 Нет токсикам
Бластим — это комьюнити, где можно похныкнать, пожаловаться и получить поддержку, а не порцию токсичности. Мы за конструктив, открытость и теплую атмосферу. Вопросы? Решим. Деньги? Вернем, если что-то пошло не так.

📍 Идея выше всего
Наши курсы — это не просто образовательный проект, а настоящий маяк для тех, кто стремится к знаниям. И чтобы быть в теме, приходится бежать быстрее Красной Королевы.

Например, наш флагманский курс по NGS. Когда мы запустили его в Пущино в 2015 году, он был первым в России. С тех пор программа обновлялась 6 раз за последние 3 года, дабы оставаться актуальной. Мы собрали более 300 выпускников, которые не просто получили корочки, но и стали экспертами. Кроме того, в рамках курса мы организуем хакатоны, чтобы студенты могли попрактиковаться, поработать в команде и порешать реальные задачки.

Наверняка секрет успеха этого курса — неизменная актуальность. Но что еще помогает курсу оставаться в авангарде? Заботливые лекторы, которые «жуют» материал до полной ясности. И, конечно, печеньки на очных встречах в Москве. Доказано: за чашкой кофе с 🍪 и на короткой ноге с преподавателями материал усваивается лучше.

До старта очередного потока курса по NGS осталось совсем немного времени. Возраст, опыт, ограничения — не преграда. Главное, чтобы было желание меняться и расти. А мы вас поддержим — словом, делом и промокодом 🫶

Читать полностью…

Вакансии нннадо? 👓

Сегодня карьерные возможности в Европе:

🇩🇪 PhD программа по микробиологии
Max Planck Institute for Terrestrial Microbiology, Марбург, Гессен, Германия
Дедлайн: 31 января 2025 года
Участвуют более 30 научных групп, охватывая такие направления, как клеточная биология, микробные сообщества, природные соединения, биофизика, физиология, системная биология.
👉 Ссылка

🇫🇷 Конкурс на позицию молодого руководителя исследовательской группы
Институт Пастера, Париж, Франция
Дедлайн: 28 февраля 2025 года
Успешные кандидаты получат постоянную позицию, возглавят группу из 6 человек, которая будет создана на 5 лет с возможностью дальнейшего формирования полноценных исследовательских групп. Направления: вакцины&иммунотерапия, инфекционные заболевания, нейроиммунология, здоровье матери и ребенка + приветствуются AI-рисечеры в сфере биологии и здравоохранения.
👉 Ссылка

🇫🇷 Постдоком на Лазурный берег
Université Côte d'Azur (UniCA), Ницца, Франция
Зарплата: 3 520€
Дедлайн: 7 марта 2025 года
Программа поддерживает молодых исследователей всех дисциплин, предоставляя двухлетние стипендии для подготовки к получению постоянной позиции или сотрудничества в подготовке заявки на европейский грант (например, ERC).
👉 Ссылка

🇸🇪 SciLifeLab PULSE: Программа для постдоков
SciLifeLab, Швеция
Дедлайн: 27 марта 2025 года
Программа предоставляет возможность для молодежи продвинуть свою карьеру в области молекулярных наук о жизни. Треки: академический (клеточная и молбиология, прецизионная медицина и др.) и предпринимательский (ML, терапевтические олигонуклеотиды и др.).
👉 Ссылка

🇨🇭 Стипендия ELISIR в области наук о жизни
EPFL, Швейцария
Дедлайн: 1 апреля 2025 года
Программа предоставляет молодым ученым возможность возглавить небольшую команду и вести независимые исследования в любой области наук о жизни.
👉 Ссылка

Больше вакансий на сайте blastim.ru

#бластим_вакансии #про_карьеру_по_субботам

Читать полностью…

А вы в курсе, что курсы Бластим — это не только знания и навыки? Несколько слов о неочевидных бонусах обучения у нас

❤️ Люди — это главное. Комьюнити
Представьте чат выпускников, где можно спросить о «затыке» в проекте, обсудить новинку отрасли или просто вдохновиться от поддержки единомышленников? Именно такой чат выпускников любого курса Бластим. И это не только на период обучения — даже через годы после выпуска можно написать, и вас обязательно услышат. А если вдруг вопрос сложный, мы подключим наших экспертов: у нас есть связи как в России, так и за её пределами — помощь найдется всегда.

🐛 Без бумажки ты букашка. Удостоверение
После успешного завершения курса и выполнения проекта вы получаете удостоверение гособразца о прохождении ДПО. Добавьте его в резюме или LinkedIn, чтобы показать работодателям, что вы действительно прокачались, ведь нам доверяют на рынке. Кстати, удостоверение легко проверить в госреестре — всё прозрачно и официально. Пример можно посмотреть здесь и тут

🚘 Тест-драйв. Пробные мини-форматы
Для тех, кто хочет «помочить ножки» в новой теме, у нас есть бесплатные вебинары и мини-курсы по доступной цене. Они помогут понять, интересна ли вам тема и хотите ли вы углубиться. Это отличный способ протестировать свои силы и почувствовать, случился ли «мэтч» с направлением, перед тем как идти на большой курс. Как раз завтра стартует наш интенсив по Линуксу

🪙 Экономика сходится. Окупить обучение
После курсов Бластим есть секретная возможность устроиться в Бластим и окупить свое обучение. Конечно, нужно приложить определенные усилия. Подробности и реальные истории — в посте

А еще на курсы можно присоединяться до старта и начинать изучение материалов по записям предыдущих потоков. Например, сейчас мы открыли доступ всем желающим к таким материалам по курсу NGS в боте предобучения: в ботъ

Расписание ближайших курсов на любой вкус можно найти на сайте учебного центра. Там весь каталог наших образовательных программ, ведь не NGS'ом единым славится Бластим 💕

Читать полностью…

🤫 Любите распутывать генетические детективы?

Или может хотите узнать про виды ДНК-отпечатков и будущее их использования из первых рук? Приходите на бесплатный вебинар от Бластим «Современные подходы к генетическому фингерпринтингу в NGS: от SNP-типирования до внешнего контроля» с Алексеем Зарубиным! Он состоится уже сегодня в 19:00 мск.

На встрече участники узнают, как избежать подмен, контаминации и других критических ошибок на этапах обработки образцов и секвенирования. Адженда включает не только теоретические основы, но и кейсы из реальной практики: от подмены пробирок на этапе сбора до ошибок в семейных анализах.

Обсудим:
• Как генетические «паспорта» предотвращают ошибки идентификации
• Какой метод внешнего контроля выбрать в зависимости от задач проекта
• Какие есть инструменты для обнаружения контаминаций и контроля качества

🔎 Этот вебинар станет полезным для всех, кто работает с генетическими данными. Да и тех, кто просто неравнодушен к детективным историям (если вы боитесь сложных терминов, не волнуйтесь — будет интересно слушателям любого уровня).

Хочу узнать как современные инструменты и практики минимизируют риски и повышают достоверность научных данных: тык

Читать полностью…

🦉Где? Когда? Что? Сегодняшняя полночь — не время для сна

Когда стрелки часов пробьют 0:00 (мск), цены на блокбастер от Бластим по NGS подымутся. Но в запасе еще 7 часов для выгодной записи на курс. Если вы, как и мы, уверены в неотъемлемости навыков в NGS, или даже считаете NGS синонимом слова «bioinformatics», то пора действовать. Зарегистрируйтесь на самую востребованную программу по биоинформатике на рынке России и СНГ здесь: clck.ru/3FjpTQ

⌛️А пока часики тикают, Бластим сыграет раунд суперблица с командой читателей Telegram: вопросы? сомнения? уточнения? Мы уже дали самые быстрые, четкие и понятные ответы на удобных карточках.

Открывайте, читайте и решайтесь

Читать полностью…

🎭 Наша жизнь — театр технологий. На сцене научных открытий постоянно разыгрываются драмы и комедии. Рассказываем, о чем скорее всего будут биотех-пьесы и пестрые заголовки в 2025 году.

😷 Откуда столько силы ты берешь
Ученые всё смелее используют большие языковые модели для копания в тоннах научной литературы, построения гипотез и анализа данных в масштабе, который человеку просто не под силу. Нас наверняка ожидает много прорывов (и немало скандалов) в области AI. Буквально сейчас, в начале года, в центре внимания — применение искусственного интеллекта для предсказания эволюции вирусов по их геному. Прошло уже 5 лет с начала COVID-19, и мечта человечества — научиться предугадывать будущие пандемии. AI-модели могут помочь: они уже умеют прогнозировать наиболее вероятные мутации и варианты вирусов, таких как SARS-CoV-2 и грипп, однако предсказывать резкие эволюционные скачки пока рановато.

😺 Быть или не быть
2025 объявлен ООН годом квантовых технологий, которые стремительно развиваются. Например, Google недавно представил, как говорят, революционный квантовый чип Willow, который должен решать задачи неподвластные нынешним суперкомпьютерам. Биоинформатику квантовые технологии тоже стороной не обходят. Они могут стать мощным драйвером в моделировании сложных биологических систем, скажем, делать молекулярные симуляции для драг дизайна.

🏎 Не в дар, но в долг
Как пишут в Science, ученые надеются, что в 2025 году выбросы парниковых газов достигнут пика или, что еще лучше, начнут снижаться. Но вот интересно, что передовые технологии оказывают разнонаправленное влияние: с одной стороны, возобновляемая энергия и электрокары способствуют сокращению эмиссии, с другой — растущие потребности дата-центров для обучения AI создают дополнительную нагрузку на окружающую среду.

🪞 Лгут зеркала, — какой же я старик
В научном мире многие, затаив дыхание, ждут прихода администрации Трампа, потому что ее решения повлекут глобальные последствия. Наиболее существенными могут стать: повторный выход США из Парижского климатического соглашения, изменения в политике в области AI, а также здравоохранения, регулирования лекарств при министре Бобе Кеннеди-мл., которому Трамп разрешил «go wild on health care».

А вы предпочитаете быть искушенным зрителем или претендуете, пусть и не на главную роль, но на место в титрах?

#выходные_у_бластим #бластим_технологии

Читать полностью…

💚 Вы еще не сгринчились за длинные праздники?

Если ваш январь пока проходит под лозунгом: «Еще неделька, и я точно постараюсь быть лучше», то у нас есть план выхода из режима послепраздничной прокрастинации.

Шаг 1
Ищем знакомые слова во фразе:
«Современные подходы к генетическому фингерпринтингу в NGS: от SNP-типирования до внешнего контроля».

Шаг 2
Вспоминаем, где мы слышали про Алексея Зарубина — человека, который помогает наводить порядок в хаосе данных студентам Бластим, опираясь на богатый опыт работы в медицинской генетике и эпигенетике.

Шаг 3
Ставим цели освоить:
· SNP-фингерпринтинг в NGS — разобраться в себе
· Внешний контроль (Spike-in, ДНК-чипы, STR) — узнать, как не терять контроль, даже когда хочется снова в плед и к мандаринкам
· Контроль качества и обнаружение контаминации (FastQC, GATK CalculateContamination) — победить не только генетическую, но и январскую «контаминацию» в планах и задачах

Шаг 4
Регистрируемся на бесплатный вебинар от Бластим по ссылке и отмечаем 15 января, 19:00 красным цветом в календаре.

Хватит откладывать жизнь QC на февраль

Читать полностью…

20 часов утра в Москве, и вот Бластим проснулся 🤪

Может быть, у вас тоже пуговицы перестали застегиваться после праздничных салатов, но знайте: на неделю предобучения Бластима по NGS с 13 января строгого костюма и не потребуется!

Ведь эта неделя пройдет в уютном онлайн-формате в нашем любимом боте. Ежедневно Бластим будет присылать вам полезные уроки по питону, R, технологиям секвенирования совершенно бесплатно. Так за 7 дней степ-бай-степ вместе мы подготовимся к серьезному анализу данных секвенирования нового поколения и далее сможем забираться в более продвинутую биоинформатику.

Как принять участие в предобучении? Нужно зарегистрироваться в боте: ссылка на бота
Стартуем в старом Новом году 👍

Читать полностью…

Как Новый год встретишь, так его и проведешь. Версия Ученый

Читать полностью…

Больше новогоднего настроения в ленту!

Читать полностью…

Всех с 2025! А где вы проводите 1 января?

Читать полностью…

🌋 Мы вывихнули челюсти, сломали языки и расплавили мозг, но справились и перевели их специально для вас! Под Новый год случаются чудеса: что на самом деле означают названия исландских вулканов, таких снежных и таких горячих, узнайте в нашем словарике-путеводителе

Активные вулканы: уже начинают «бурлить» знаниями

Скьяльдбрейдюр
Перевод: бесплатный вебинар по NGS с Алексеем Зарубиным
Дата вулканической активности: 15 января, 19:00 мск
Записаться: ссылка

Фаградальсфьядль
Перевод: Экспресс Linux для NGS
Резкий и дерзкий выбух знаний для тех, кто хочет освоить базовые навыки командной строки быстро и эффективно
Дата активности: 18–19 января
Детальнее: u.to/hMgdIQ

Эйяфьядлайёкюдль
Перевод: Анализ NGS-данных
Магматический очаг обработки данных секвенирования. Среди прочего научимся строить volcano plot. И да, у нас безопасно, лава знаний контролируемая
Дата активности: 27 января–9 февраля
Извержение можно наблюдать офлайн и онлайн
Зарегистрироваться: u.to/0ccdIQ

Тунгнафедльсйёкюдль
Перевод: Python для анализа данных в науке
Залезем в самое жерло программирования
Дата активности: 24 февраля–29 марта
Подробности: u.to/FcgdIQ

Дремлющие вулканы: вот-вот проснутся

Баурдарбунга
Перевод: Статистика, R и анализ данных
Кипящая лава знаний по статистике
Дата активности: 26–30 мая, 7–8, 14–15 июня
Извержение можно наблюдать офлайн и онлайн
Забронировать место: u.to/3McdIQ

Фремринаумюр
Перевод: Учёный будущего: интеграция ИИ в научную работу
От непонимания искусственного интеллекта останется лишь пепел
Дата активности: 17 июня–5 июля
Вся информация: u.to/aMgdIQ

Эрайвайёкюдль
Перевод: Машинное обучение на Python для решения биоинформатических задач
Ваши знания по ML будут тверже базальта
Дата активности: июль 2025
Узнать больше: u.to/TcgdIQ

Покорение научных вершин — задача не из легких, но если вы сумели выговорить названия, то и наши курсы вам будут по плечу. Го с нами на хайкинг по вулканам знаний в 2025!

#бластим_дайджест

Читать полностью…

От поздравления до подарка: сегодня нестандартно абсолютно фсё

В рамках очередного дня адвент-календаря прекрасные Альбина и Регина, которые лучше всех из команды Бластим знакомы участникам курсов и мероприятий, записали оригинальное новогоднее поздравление. Сильное видео ❤️ на экране!

А учиться — действительно, самое главное. Но как начать прокачивать свои скиллы? Страшно же не потянуть командную строку, не осилить вес программирования и молекулярщины. Мы это учли и презентуем наш сюрприз. Специально для всех страждущих Бластим запускает неделю бесплатного предобучения к курсу «Анализ NGS-данных».

• Чтобы преодолеть активационный барьер
• Чтобы подтянуть знания по питону и R
• Чтобы познакомиться с базой технологий секвенирования и пробоподготовкой

🎄 Переходите по ссылке для регистрации: ссылка на бота
Тренажер заработает 13 января.

P.S. Важное напоминание: сегодня ночью состоится подорожание курса по NGS. Есть еще несколько часов, пока Гринч не похитил старогодние цены. Сейчас отличный случай записаться, в январе пройти предобучение, а потом сам курс и так вкатиться в продвинутую биоинформатику вместе с Бластим

Читать полностью…

Последний рабочий день, а в Бластим не останавливается неделя подарков 🦌

И пока мы не распаковали очередной презент, спешим поделиться любопытным наблюдением 🎁

В декабре одна небезызвестная компания тоже проводила адвент-календарь и 12 дней релизила новинки. С Бластимом у нее вообще много общего — смотрите на картинке. Но нашлись и отличия: к примеру, у нас прямо сейчас можно легко выиграть 95% скидку на любой курс по биоинфе, машинленингу, кодингу. Условия конкурса максимально просты, читайте и участвуйте тут: ссылка

Итоги подведем уже 31 декабря

Читать полностью…

Биоинформатика прапрапра

2,5 тыс лет назад на юго-западе Германии процветала культура ранних кельтов: племена богатели благодаря освоению технологий железного века, покупали предметы роскоши на Балтике и в Средиземноморье, а их поселения были очень развитыми. Но как был устроен их социум?

Один из современных инструментов для расшифровки социально-политического устройства обществ прошлого — это древняя ДНК. Снижение стоимости секвенирования и передовые техники экстракции ДНК позволили погрузиться в тайны ушедших эпох.

💀 Благодаря росту числа находок скелетов и бурному секвенированию геномов базы данных пополняются экспоненциально. И сейчас палеогенетики анализируют прошлое не на уровне популяции, а детально изучают отдельных индивидов и их родню. Используя идентичные по происхождению блоки ДНК (identity by descent, IBD), они научились находить семейные связи и даже реконструировать генеалогические деревья людей прошлого. Например, однажды была обнаружена пара родственников 5-ой степени родства, похороненных 5 тыс. лет назад на расстоянии 1,5 тыс км друг от друга. К слову, такой же IBD-анализ применяют коммерческие компании, такие как 23andMe, чтобы искать прапрабабушек/дедушек в базах данных нынешних людей 🧬

👑 Но вернемся к кельтам. Ученые из института эволюционной антропологии отсеквенировали 31 образец ДНК из костей и зубов доисторических людей в курганах в Эбердинген-Хохдорф и Асперг-Графенбюль в Германии. Эти два захоронения, богатые золотом, янтарем и слоновой костью, служили последним пристанищем для двух влиятельных кельтских аристократов.

Изучение погребальных принадлежностей из изысканно украшенных гробниц и анализ ядерной и митохондриальной ДНК позволили разобраться в родстве и социальной структуре. Ученые использовали новый биоинформатический тул ancIBD, который находит общие по происхождению блоки, даже когда ДНК сильно деградирована и прочтений низкого качества — ancient DNA именно такая.

Палеогенетики пришли к выводу, что сестра мужчины из Хохдорфской гробницы, скорее всего, была матерью мужчины из Графенбюля. Это подтверждение гипотезы о наследовании статуса по материнской линии у кельтской элиты, о котором писали еще древнеримские историки. Сегодня матрилинейность характерна всего для 12–17% населения планеты, и в доисторической Европе она также не встречалась. Одна из причин, почему такой уклад мог возникнуть у кельтов, — это неверность жен. Если вы сомневаетесь в преданности своей супруги, то вы всегда можете быть уверены, что дети вашей сестры — ваши родственники. Но, возможно, у общества кельтов было пять других причин 😏

Так, свежие работы показали, что 2 тыс лет назад Британия вообще была царством женщин до прихода патриархальных римлян. Погребальный инвентарь женщин племени дуротригов был значительно богаче мужских. Именно мужчины оставляли свой род и присоединялись к клану жены. А имущество наследовалось от матерей к дочерям. И это подтверждает генетический след: с 500 г. до н. э. разнообразие мтДНК людей снизилось. Получается, что у большего числа людей были одни и те же предки по материнской линии. Тогда как снижения разнообразия Y-хромосом не наблюдалось.

Археологией и биоинформатикой можно добиться куда большего, чем одной только археологией 💪

На полях заметим, что у нас на курсе по NGS тоже будет спец по древней ДНК и эпигенетике Дарья Бородко. Приходите познакомиться!

Читать полностью…

🧬 В ДНК, безусловно, много смысла, но без поддержки, без опоры, без гистонов никуда!

«8 коровых и 1 линкерный» нужны всем ученым, мы вас уверяем. И речь про восьмерку преподавателей курса «Анализ NGS-данных» и лидера — мэтра Евгения Герасимова, самого любимого «гистона H1».

Наши преподаватели работают в топовых институтах и постоянно ведут исследования. Про научный бэкграунд и профессиональные интересы лекторов вы можете подробнее узнать в разделе «Преподаватели курса» на сайте: clck.ru/3FrKAa

Как гистоны в клетке творят чудеса, упаковывая метры ДНКи в крошечное ядро, так и эксперты Бластим помогают нашим студентам эффективно упаковывать в себя знания. На занятиях они делятся опытом, полезными наработками, лайфхаками и учат избегать ошибок. Приходите триммировать, выравнивать, аннотировать, снипколлить, — в общем, работать с ДНКой в компании умных и энергичных людей.

❗️Обращаем внимание: сегодня повышение цены на курс. Примените до 23:59 мск свои промокоды и заберите всевозможные бонусы до старта занятий. А если у вас остались вопросы, пожалуйста, пишите Анастасии Бластим: @anamur_blastim

Старт NGS ровно через неделю 27 января

Читать полностью…

⚡️ Сообщение для всех, кто мечтает о сервере

Друзья, если вы ждали тайный пятничный знак, то вот он! До старта «Экспресс Linux» остается всего 12 часов. В связи с этим важная организационная информация:

🎙 Все занятия будут записаны, чтобы вы могли их пересматривать

💻 Сервер для практики будет доступен:

🗓 18–19 января (основные дни курса)
🗓 20–21 января (еще 2 дополнительных дня для работы)
🎯 Бонус: если вы регистрируетесь на курс по NGS-анализу данных (старт 27 января), сможете использовать сервер до 21 февраля и повторять команды c курса по Linux в удобное для вас время

🐧 Не пропустите возможность — интенсив уже завтра с 10:00 мск

Читать полностью…

Linux-пробег уже в этот уикенд 🚗

🧣Живи Остап Бендер в наши дни, то наверняка он в биоинформатики подался бы. Здесь точно пригодятся выдающиеся способности комбинатора. И как вы думаете, с чего он бы начал свой путь? Конечно же, отправился в пробег по командной строке!

В ближайшие субботу-воскресенье 18–19 января Бластим как раз проводит такой — это «Экспресс Linux для NGS». На интенсиве вы освоите все необходимые команды командной строки и полезные сочетания клавиш, поймете азы системного администрирования и получите ценный практический опыт работы на сервере. Это даст вам в руки чемоданчик с миллионом инструментов на будущее, чтобы потом учиться на более сложных курсах по биоинформатике.

🎫 Билет участника можно приобрести на кассе: ссылка на expresslinux

Пересаживайтесь на антилопу GNU/Linux вместе с Бластим!

Читать полностью…

😑 Случалось ли вам подозревать себя или коллег в недобросовестной подготовке проб? К сожалению, такие сомнения не всегда беспочвенны. Человеческий фактор бывает безжалостным.

Вот реальная история из практики

В 2022 году в одном онкологическом центре штата Флорида при анализе генетических образцов обнаружилось несоответствие. Типичная для полицитемии вера (редкой формы рака крови) мутация в гене JAK2 отсутствовала у пациента с этим диагнозом. Одновременно, у другого пациента с грибовидным микозом, для которого такая мутация крайне не характерна, она вдруг детектировалась. Самое очевидное объяснение: образцы перепутали на этапе пробоподготовки.

Но не все так просто

Полностью повторить анализ — долго, дорого и непрактично. Вместо этого можно прибегнуть к ДНК-фингерпринтингу и сравнить библиотечные препараты с оригинальными образцами пациентов.

ДНК-фингерпринтинг — незаменимый метод в геномных исследованиях, медицинских тестах и криминалистике. Он позволяет закрепить за каждым образцом уникальный набор ДНК-маркеров. C помощью таких генетических «отпечатков пальцев» можно различать образцы даже после специфической пробоподготовки, например, для RT-qPCR.

В бухгалтерии все перепутали

ДНК-фингерпринтинг показал, что физической подмены образцов не было. Причина оказалась куда прозаичнее. Расследование выявило канцелярскую ошибку. Диагноз второго пациента изначально был записан как MF, что интерпретировали как «Mycosis Fungoides» (грибовидный микоз). Однако на самом деле под MF имели в виду «миелофиброз» — заболевание, которое, в отличие от микоза, как раз часто связано с мутацией в JAK2.

❓ Но почему же у первого пациента не было ожидаемой мутации? Впрочем, это уже совсем другая история…

Мораль

Ошибки в подписях или интерпретации сокращений могут иметь серьезные последствия. Но такие ситуации можно предотвратить, быстро выявить или даже исправить, если использовать ДНК-фингерпринтинг как часть системы контроля качества.

Читать полностью…

⚡️Шах и мат, NGS!

Понедельник, 13 января, а это значит, что сегодня в Бластим наконец-то открылся бот предобучения к курсу «Анализ NGS-данных» ♟

Напоминаем, что это за чудо такое. Целую неделю мы будем совершенно бесплатно делиться (уже делимся!) полезными видео и не только. Это избавит вас от страха перед NGS, вызванного нехваткой априорных знаний по молбио, статистике или программированию.

Если:
✅ хотите быстро подтянуть знания по питону и R, то заходите в бота: ссылка
✅ не очень знакомы с пробоподготовкой и технологиями секвенирования, то добро пожаловать в бота: ссылка
✅ мечтаете познакомиться с лекторами NGS, получить эксклюзивные материалы и начать плавно вкатываться в сферу, то тоже переходите в бота: ссылка

Вступайте в игру! Первый урок и задания к нему уже доступны 💯

Бот — супердополнение к интенсиву по Linux и вебинару с Алексом Зарубиным

Читать полностью…

Программирование доводит вас до слез? 😭

Тогда самое время заглянуть на страничку «Экспресс-Линукса для NGS» — практического интенсива по командной строке, написанию скриптов и первому знакомству с биоинформатическими утилитами.

Почему Linux нужен ученым как воздух:
◦ работа с последовательностями ДНК/РНК/белков вручную — долго и с ошибками, а Linux позволяет экономить время и быть уверенным в результате
◦ научный софт зачастую создан под терминал, аналогов с графическим интерфейсом просто нет
◦ линуксовые команды, которые вы освоите, универсальны: от бытовой техники до суперкомпьютеров везде одно и то же
◦ знание Linux и Bash обязательно во всех биоинф-вакансиях

Программа Бластим позволит почувствовать себя уверенно в черном терминале, приобрести свободу действий и двигаться дальше

День 1. Введение
>> о философской стороне: почему Linux + биоинформатика = ❤️
>> овладеем необходимыми командами командной строки
>> научимся подключаться к удаленному серверу, навигации в файловой системе, построению пайплайнов

День 2. Настройка рабочего окружения
>> выучим базовый синтаксис Bash
>> поймем принципы управления процессами и освоим текстовые редакторы
>> заберемся в виртуальные окружения и мультиплексируем терминалы

👨‍💻 Преподаватель: Андрей Томаровский, эксперт в области администрирования биоинформатических кластеров и спец в NGS-пайплайнах

Кстати, Экспресс-Linux — это самый доступный курс от Бластим. Переходите по ссылке: https://agency.blastim.ru/expresslinux

Собираемся в следующий уикенд 18-19 января и ботаем 2 дня, чтобы больше не плакать над кодом

Читать полностью…

Затяжные выходные — всё

Читать полностью…

🤩 Пока все отдыхают, мы уже планируем активности на 2025 год. Присоединяйтесь и не забудьте сохранить эту подборку в избранное!

📅 Самые интересные события в биотехе:

📌 22–24 января в Москве
Международная выставка технологий для профессионалов АПК «Agros 2025 expo». Регистрация здесь

📌 10–13 февраля 2025 в ГНЦ ИБХ РАН
Школа 2025: XXXVII международная зимняя молодёжная научная школа «Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии» и Конкурс молодых учёных. Все подробности здесь

📌 17–21 марта в Сыктывкаре
XXXII Всероссийская молодежная научная конференция «Актуальные проблемы биологии и экологии». Жителям северной части России рекомендуем присмотреться. Сайт конференции

📌 22–30 марта
NGS-школа в Польше, которую очень рекомендуют наши коллеги. Все подробности в Линкендине. Регистрация скоро закончится! Не откладывайте

📌 27 марта
Пробиотех. Сайт конференции

📌 Mccmb-2025
В этом году будет конференция, скоро появятся актуальные даты на сайте: ссылка

🔍 И для тех, кто спрашивает, где искать ярмарки вакансий, рекомендуем обратить внимание на наших коллег — Российский Диагностический Саммит: ссылка

💬 Уже начали планировать год? Делитесь в комментариях!

#бластим_подборка

Читать полностью…

📱 Что скрывается за успешным позиционированием в LinkedIn?

Длинные каникулы — отличное время для погружения в интересные и полезные материалы

Хорошенько отдохнули с легкой ненавязчивой комедией? 🧠 Пора поработать мозгами.

Рекомендуем классное видеоинтервью нашего директора Виты (https://youtu.be/XHy_DV597p8), в котором максимально подробно и с рабочими лайфхаками рассказывается:

✅ как развивать свое позиционирование в ЛинкедИне;
✅ как зарабатывать на инвестициях в биотех;
✅ где сейчас самые горячие темы в биотехе;
✅ и чем могут быть интересны Франция и Ближний Восток для тех, кто хочет развиваться глобально.

📢 Интервью длинное, ориентируйтесь на таймкоды ⚠️ И обязательно подпишитесь на vitastepanova80">канал Виты, если интересно слушать про необычные профессии и предпринимательство

#про_карьеру_по_субботам

Читать полностью…

Желаем каждому учёному в новом году по гранту!

Читать полностью…

Та-дам! Друзья, внимание: поздравление Виты и долгожданные итоги конкурса!

💔 Наши сердечки растаяли и мы не только выбрали одного победителя, но и решили отметить призами самых активных и ярких участников. Итак:

@sacralitus покорил нас и забирает 95% скидку на любой курс Бластим 🏆
@entalltseva, которая копит на питон, получает 70% скидку на питон 🐍
@salimovdr мы приглашаем вас сняться у нас в ролике 🎥
@makolga, @Notwillsmitha, Ирина Хохлова получают от нас бесплатную карьерную консультацию 🤩

А также всем-всем-всем конкурсантам достается фирменный мерч от Бластим (будет чуть позже в январе)

Спасибо, что вы остаетесь с Бластимом и выбираете наши курсы по биоинформатике, ИИ, программированию. С Новым кодом!

Читать полностью…

Каждый год Впервые 31 декабря 30 декабря мы с друзьями ходим в лабу слушаем новогоднее обращение сооснователя Бластима Юрия Пекова 👏

Такое поздравление само по себе подарок, правда? Но подождите, у нас ещё остались сюрпризы в адвент-календаре!

15 января нового 2025 года в 19:00 мск мы организуем бесплатный вебинар по NGS с Алексеем Зарубиным, опытным специалистом в клинической биоинформатике и медицинской генетике. Всех очень ждём! Записаться можно уже сейчас в один клик в боте.

P.S. Даже если в голове уже сплошной джингл-белз и мысли только об оливье, напоминаем, завтра станут известны результаты розыгрыша 95% скидки на любой курс Бластим. Не пропустите 🎁

Читать полностью…

😄 Учись, когда удобно: курсы Бластим в записи

Друзья, а у нас седьмой день адвент-календаря и вас поздравляет бухгалтер Бластим Надежда:

Дорогие коллеги, искатели истины и покорители графиков!
2025 уже стучится в двери, а значит, пора подвести итоги и загадать желания.

В новом году пусть ваши гранты выигрываются, эксперименты заканчиваются публикациями в Q1, а графики всегда выходят значимыми и красивыми!

Желаем, чтобы каждый проект приносил финансовый успех, зарплаты росли, как экспоненциальные функции, а карьерный путь стремился к максимуму:)

Пусть коллеги будут дружелюбны, реактивы свежи, а бюрократия сведена к минимуму! И, конечно, чтобы у каждого было время для отдыха и новых открытий.

С Новым годом, дорогие учёные! Пусть ваши идеи меняют мир!

Знаем, что разница во времени может мешать участвовать в живых вебинарах. Во время Чёрной пятницы вы активно спрашивали про курсы в записи — и мы вас услышали. Встречайте! В качестве сегодняшнего подарка подготовили целую страницу вебинаров и интенсивов в записи: тутъ

Теперь вы можете:
• Учиться в удобное время
• Повторять материал сколько угодно
• Не зависеть от часовых поясов

Программы Бластим в записи уже ждут вас: здеся

🔥 А какие классические курсы Бластим вы бы хотели видеть в записи? Проголосуйте ниже, и в наступающем мы обязательно учтем ваши пожелания!

Читать полностью…

🧑‍💻 Шестой день адвент-календаря и подарок от мистера 🔤

Публикуем мега-классный список компаний на пересечении биологии и ai. За ними однозначно стоит следить, особенно если вы ищете работу в индустрии в России или за рубежом.

Отечественные ai & биотех-компании:
» Ksitest
» Gero.AI
» ImmunoMind
» Syntelly
» BostonGene
» Геноаналитика
» Oncobox
» Atlas
» BioCad

Мировые компании, создающие ai-модели для биотеха:
• Isomorphic Labs
• Insilico Medicine
• Benevolent AI
• Recursion
• Quantori
• Exscientia
• Adaptyv Bio
• Absci
• Xtalpi
• AtomicAI
• Calico
• Insitro
• DeepGenomics
• Instadeep BioAI
• Biomap
• Arc Institute
• Bioptic
• Aqemia
• Xaira Therapeutics
• BigHat Biosciences
• Generate:Biomedicines
• Atomwise
• Ginkgo Bioworks
• Owkin
• Evolutionary scale
• Genetic Leap
• Ornatx
• VantAI

Фармкомпании, внедряющие ai:
:: Mersk
:: Sanofi
:: Roche
:: AbbVie
:: Moderna
:: Novo Nordisk
:: Novartis
:: AstraZeneca
:: Eli Lilly
:: Almirall

IT-гиганты, занимающиеся биотехом:
+ Google DeepMind
+ MetaAI
+ Salesforce
+ Nvidia

🎄 Добавляйте себе в сохраненки и делитесь с коллегами! А также рекомендуем заглянуть в раздел нашего сайта, где еще больше компаний: blastim.ru/companies/

#бластим_подборка

Читать полностью…