sberlogabio | Unsorted

Telegram-канал sberlogabio - (sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

3112

Биоинформатика, дата сайнс, биология. Основное правило - вежливое и уважительное общение. @sberlogabig - основной канал @sberlogasci математика, физика, ДС @sberloga_discussion за жизнь Доклады: https://www.youtube.com/c/SciBerloga

Subscribe to a channel

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Добро пожаловать в (sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club, Чингиз Монгуш
Напиши пару слов о себе 👍

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Добро пожаловать в (sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club, Dima
Напиши пару слов о себе 👍

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

вычисление поведения молекул на обычных кластерах

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Что-то я запутался.
Под квантовыми вы понимаете расчёты квантовых процессов или вычисления на квантовых алгоритмах, которые считаются на квантовых компьютерах (ну или эмуляторах)?

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

ну лазейки всегда можно найти. Лучшие акселерационные структуры, что-то подрезать, проанализировать квантизацию данных, что-то на текстурных юнитах считать и т.п.

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

мб. Это останется тайной :)

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Там международная команда была

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

я вот буквально по свежему примеру говорю, одну технологию (gaussian splatting) допилил, так что она стала радикально лучше, чем у всех остальных.

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Та же не в софте проблема, а в харде

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Короче от мокрых методов никуда мы не денемся

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

ФФТ уже потом переоткрыли (вроде как придумал его ещё Гаусс)

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Моя любимая история про ФФТ это то, что его начали активно использовать в холодную войну, когда встал вопрос о детектировани ядерных взрывов по акустическим данным

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

А ссылку так никто и не принёс

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Древние греки очень разные модели имели.
А я профессионально не верю нейронкам в биотехе. По принципу: используй их когда не знаешь что делать.
Мне кажется, что можно оптимизировать квантовые вычисления и получить лучший результат.

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

📆 Что обсуждалось вчера 27.12.2025

Сложности курсов и научных исследований (8 сообщений)
Исторический контекст и обучение (2 сообщений)
Психологические аспекты работы и учебы (2 сообщений)

#dailysummary | ⭐️ поддержать команду

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

📆 Что обсуждалось вчера 28.12.2025

Квантовые вычисления и их применение в биотехе (7 сообщений)
Исторические астрономические модели и их точность (5 сообщений)
Оптимизация программирования и вычислительных процессов (5 сообщений)
Использование Фурье-анализа в различных областях (3 сообщений)

#dailysummary | ⭐️ поддержать команду

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Добро пожаловать в (sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club, Андрей
Напиши пару слов о себе 👍

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

а я почему-то поехал башкой и хотел написать про квантовые вычисления, но заболтался и написал про квантовую химию. но в идеале это связанные вещи

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

к слову о фурье - делал компрессию jpeg для текстур в 3Д. Если учитывать фактор значимости пикселя - удавалось неплохо уменьшить размеры файла.

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Квантовые вычисления все же в среднем вероятно написаны сильно лучше с точки зрения оптимизации, потому что физики и теорхимики в вычислениях понимают побольше.

То есть там не будет совсем детских косяков, которые есть в молбио

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Квантовыми вычислениями уже давно занимается в том числе и Гугл, а он умеет оптимизировать ;))

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

https://m.youtube.com/watch?v=nmgFG7PUHfo&pp=ygUcdmVyaXRhc2l1bSBmb3VyaWVyIHRyYW5zZm9ybQ%3D%3D

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Обалдеть, и из-за плеча fftw выглядывает американский товарищ майор из ДАРПА? :))

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Возможно. Я когда-то шёл на квантовика, но это было в прошлом тысячелетии и недолго.
А вот по существу - с тех пор стал программистом с упором в оптимизации, и по наблюдению - всё что напрограммируют учёные можно относительно легко ускорить на порядок. Чем регулярно и занимаюсь. И вот про квантовые вычисления думаю - не получится ли так, что если я за них сяду, то они внезапно забегают, как надо.

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Это всё да, но в целом ситуация в области фолдинга белка забавная. С одной стороны есть физика - МД, но посчитать ей фолдинг не получится из-за вычислительной сложности (и отдельна забавная история, откуда force fields берутся - Птолемей бы позавидовал :)) ). С другой стороны, есть чёрные ящики МЛ моделей, выдающие конечный результат, но там куча нюансов, тонкостей и ограничений - может на твоём объекте сработать, а может и нет. Решение получилось как-бы недостаточно общим, хотя в практическом плане и покрывающим бОльшую часть вариантов.

А с квантовыми вычислениями интересная история - я буквально пару недель назад болтал на ретрите с коллегой, который ПхД делал в Цюрихе по квантовым вычислениям - они делали алгоритм как раз для квантовых вычислений фолдинга белка :))) В результате лично он не верит, что квантовые вычисления в обозримом будущем будут выдавать полезные практические результаты - с его точки зрения там слишком много фундаментальных проблем надо решить для практического применения.

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Причём сначала не хватало мощностей на обычное ФТ, быстрого ещё не было, поэтому в 60-х толком это не получалось делать и в итоге решили, что все испытания не отследить и никак не стали на уровне государств это блокировать

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

https://m.youtube.com/watch?v=spUNpyF58BY&pp=ygUdZm91cmllciB0cmFuc2Zvcm0gM2JsdWUxYnJvd27SBwkJTQoBhyohjO8%3D

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

Вот на связанную тему: /channel/chelovek_nauk/923

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

А ещё это объясняет, почему систему Коперника сто лет не принимали «гады-инквизиторы» :))) Он считал орбиты окружностями, и в результате расхождение с наблюдением у него было больше, чем у Птолемеевских сфер с идеально подогнанными коэффициентами. Пока Кеплер не ввёл поправки на эллиптичность орбит через почти сто лет - тогда система Коперника и заработала.

Мякотка в том, что древние греки походу реально думали, что на небе прозрачные сферы крутятся :))) и были одновременно правы и не правы - отличная иллюстрация того, что высокая точность и предсказательная сила мат. модели не означает, что принципы в основе модели соответствуют физике процесса :)) Это ещё и к вопросу о том, выучил АльфаФолд физику или нет :))

Читать полностью…

(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club

У автора 3b1b секторная гетерохромия: радужка на 1/4 каряя и на 3/4 голубая. И он решил использовать это как нестандартную основу для символики канала

Читать полностью…
Subscribe to a channel